247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6143 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  440  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  40.51 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  37.43 
 
 		 189 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  36.42 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  30.57 
 
 		 227 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  30.15 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  29.21 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  28.14 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  30.63 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  28.08 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  27.74 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  25.26 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  26.42 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  27.67 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  36.04 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  24.73 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  28.12 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  32.48 
 
 		 344 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  30.37 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  31.9 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  26.12 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  32.06 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  32.99 
 
 		 344 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  35.23 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  31.96 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  31.11 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  26.83 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  28.65 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  31.3 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  31.96 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  31.96 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  32.99 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  32.99 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  31.96 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  36.36 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 369 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 369 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  34.48 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  29.75 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  42.65 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  31.73 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  36.46 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  34.69 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  33.33 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 333 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  30.21 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  30.93 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  32.94 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  33.02 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  33.02 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  30.28 
 
 		 373 aa  55.1  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 369 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.08 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35 
 
 		 429 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  35.79 
 
 		 466 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 372 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 376 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.33 
 
 		 447 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  37.62 
 
 		 433 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  25.56 
 
 		 420 aa  52  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  34.15 
 
 		 372 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 457 aa  52  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  35.05 
 
 		 432 aa  52  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  31.71 
 
 		 377 aa  52  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 454 aa  51.6  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.71 
 
 		 427 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  34.02 
 
 		 434 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  34.04 
 
 		 880 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.48 
 
 		 172 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  36.49 
 
 		 739 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  32.41 
 
 		 375 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  34.41 
 
 		 703 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  34.52 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  34.52 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  34.52 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  30.93 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  27.68 
 
 		 727 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  32.29 
 
 		 742 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  34.07 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0165  peptidoglycan-associated lipoprotein  28.85 
 
 		 174 aa  49.7  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  29 
 
 		 310 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  27.61 
 
 		 170 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  30.84 
 
 		 360 aa  49.3  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  33.68 
 
 		 332 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  34.34 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0280  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.25 
 
 		 168 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  29 
 
 		 310 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  29 
 
 		 310 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  29 
 
 		 310 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  31 
 
 		 316 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  35.11 
 
 		 399 aa  48.9  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  31 
 
 		 316 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  29 
 
 		 310 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>