More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6949 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  68.16 
 
 		 189 aa  262  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  53.72 
 
 		 220 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  37.7 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  42.06 
 
 		 212 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  37.38 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  41.12 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  35.19 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  43.27 
 
 		 333 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  38.32 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  37.27 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  35.86 
 
 		 201 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  37.98 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 498 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  39.05 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 213 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  31.53 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  37.14 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  34.44 
 
 		 331 aa  64.7  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 		 326 aa  64.3  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  32.11 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  37.96 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 487 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  34.97 
 
 		 497 aa  62.8  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  45.33 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 487 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  39.42 
 
 		 484 aa  61.2  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 487 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  30.91 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  34.82 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  47.95 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  30.26 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  30.28 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 333 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  28.91 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.75 
 
 		 427 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  44.12 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  34.11 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  34.11 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  31.82 
 
 		 443 aa  58.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  30.09 
 
 		 380 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  38.61 
 
 		 352 aa  58.2  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  32.38 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  34.23 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  29.82 
 
 		 344 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  36.79 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  32.56 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  32.19 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  33.98 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 623 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  36.04 
 
 		 368 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  34.31 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  31.94 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  33.93 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  32.19 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  28.95 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3487  OmpA/MotB domain-containing protein  34.88 
 
 		 522 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.662497  normal  0.283139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  37.07 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  33.98 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2205  outer membrane protein, porin-associated lipoprotein  29.63 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.604308  hitchhiker  0.00226867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0933  OmpA/MotB domain-containing protein  34.51 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.330264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  38.32 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  37.07 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  36.54 
 
 		 364 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1474  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  32.17 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  28.07 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  32.17 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0784  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0131111  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  28.07 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  28.07 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  33.96 
 
 		 712 aa  55.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 485 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  33.63 
 
 		 640 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>