More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5114 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 189 aa  383  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  68.16 
 
 		 189 aa  262  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  57.02 
 
 		 220 aa  141  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  36.84 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  39.25 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  36.45 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  33.64 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  35.51 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  31.15 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 222 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  33.64 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  37.5 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  43.27 
 
 		 352 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  30 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  39.05 
 
 		 332 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 498 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  32.89 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  34.25 
 
 		 331 aa  64.7  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  35.07 
 
 		 433 aa  64.7  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  34.82 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  34.69 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  29.73 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 479 aa  62  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  37.04 
 
 		 334 aa  62  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  31.3 
 
 		 286 aa  61.6  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  42.65 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  32.52 
 
 		 377 aa  62  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  33.91 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  30.63 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  32.11 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  33.03 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  31.03 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  35.85 
 
 		 712 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  33.98 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  28.65 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  34.62 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  30.58 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 443 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  28.79 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  31.5 
 
 		 447 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  32.14 
 
 		 381 aa  58.9  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  34.15 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 		 367 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  28.03 
 
 		 344 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  28.03 
 
 		 344 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  28.03 
 
 		 344 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  33.96 
 
 		 337 aa  58.2  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 497 aa  58.2  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 372 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 372 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  34.96 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  34.96 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  27.27 
 
 		 344 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  32.38 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  34.55 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  30.7 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  32.23 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.94 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  36.54 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  34.68 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  34.23 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  34 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  33.33 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  28.03 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  32.38 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  31.73 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  33.65 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  31.73 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  33.96 
 
 		 349 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0899  OmpA/MotB  40.85 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025431  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  32.14 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  28.95 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  33 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  42.65 
 
 		 703 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  32.5 
 
 		 640 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>