39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0321 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  100 
 
 		 651 aa  1203    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  87.09 
 
 		 697 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  89.38 
 
 		 306 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  68.09 
 
 		 673 aa  481  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  76.3 
 
 		 727 aa  442  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  65.56 
 
 		 663 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  60 
 
 		 723 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  59.73 
 
 		 666 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  58.47 
 
 		 717 aa  321  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  59.73 
 
 		 624 aa  309  8e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  59.04 
 
 		 348 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  44.48 
 
 		 742 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  46.91 
 
 		 880 aa  242  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  45.98 
 
 		 720 aa  241  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  43.06 
 
 		 739 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 		 742 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  43.29 
 
 		 703 aa  223  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  43.84 
 
 		 711 aa  202  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  41.54 
 
 		 730 aa  190  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.68 
 
 		 701 aa  187  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  39.68 
 
 		 701 aa  187  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 		 638 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  36.55 
 
 		 227 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  36.52 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  42.45 
 
 		 229 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  37.58 
 
 		 222 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  38.94 
 
 		 212 aa  69.3  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  38.03 
 
 		 213 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  38.1 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  36.04 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  40 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  36.07 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  33.59 
 
 		 213 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  35.71 
 
 		 217 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  35.61 
 
 		 239 aa  62  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  35.25 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  37.21 
 
 		 1619 aa  58.2  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>