More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001183 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  100 
 
 		 339 aa  704    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  60.86 
 
 		 350 aa  421  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  37.85 
 
 		 295 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  32.38 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  29.62 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  30.8 
 
 		 322 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  32.06 
 
 		 296 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  26.16 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  28.46 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  26.86 
 
 		 302 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  25.83 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  25.34 
 
 		 317 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  25 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  28.35 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  29.18 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  25.34 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  29.18 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  29.18 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  29.18 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  28.83 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  25.09 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  28.29 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  26.4 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  27.76 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  27.76 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  25.6 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  25.68 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  27.76 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  26.74 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  26.74 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  26.41 
 
 		 289 aa  94  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  25.68 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  27.31 
 
 		 289 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  25.98 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  25 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  25.11 
 
 		 301 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  25.2 
 
 		 321 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  24.37 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  24.7 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  24.38 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  42.06 
 
 		 241 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  38.68 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  25.29 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  34.59 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  37.27 
 
 		 890 aa  75.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  22.34 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  36.94 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40 
 
 		 707 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  36.94 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  36.94 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  34.43 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  36.04 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  35.4 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  34.23 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  33.61 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  34.45 
 
 		 263 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 1755 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  36.73 
 
 		 544 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  28.33 
 
 		 319 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  21.91 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  45.83 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  39.56 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  43.33 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  34.72 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  41.18 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.71 
 
 		 542 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  32.43 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  34.69 
 
 		 543 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  40.78 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  28.21 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  27.22 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  35.24 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  37.5 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  27.22 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  45.98 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.6 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  37.07 
 
 		 670 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  32.63 
 
 		 525 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>