More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3328 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  100 
 
 		 273 aa  554  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2051  OmpA/MotB domain-containing protein  32.87 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0438316  hitchhiker  0.0000220927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  47.17 
 
 		 373 aa  95.5  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  45.79 
 
 		 373 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  42.74 
 
 		 373 aa  92.4  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  40.35 
 
 		 357 aa  86.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  34.75 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  47.52 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  42.06 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 364 aa  79  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  46.53 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  40.19 
 
 		 212 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  44.66 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  38.71 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36.36 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  38.79 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1314  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.07 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.71 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  41.8 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 		 498 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  37.07 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3400  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.75 
 
 		 172 aa  72  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  43.69 
 
 		 179 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0783  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.19 
 
 		 169 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.32 
 
 		 164 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  39.25 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3080  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.52 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.430069  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.5 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  35.46 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4671  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1210  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.35 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  37.06 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  43.69 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  42.72 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  42.72 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0100  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  33.64 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.949654  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.94 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.94 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 623 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  38.46 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.09 
 
 		 177 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  32.87 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  43.69 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.72 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.79 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  38.61 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.59 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0668  OmpA/MotB family protein  32.81 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.942269  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0165  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.05 
 
 		 174 aa  68.2  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2321  OmpA domain-containing protein  32.81 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149229  normal  0.659387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.17 
 
 		 199 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  35.34 
 
 		 149 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  32.62 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2714  OmpA/MotB  35.04 
 
 		 167 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  32.62 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  30 
 
 		 626 aa  67  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3509  OmpA/MotB  35.34 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3482  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.784899  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  35.29 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.27 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  36.45 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  35.29 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4401  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  41.28 
 
 		 481 aa  66.2  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  39 
 
 		 509 aa  66.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3418  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  36.79 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3086  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1250  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000441417  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3992  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.75 
 
 		 165 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  41.75 
 
 		 166 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1234  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 196 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455837  normal  0.175097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  34.45 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  36.59 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5131  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 170 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.75 
 
 		 166 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.54 
 
 		 168 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.75 
 
 		 166 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  38.24 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3403  OmpA/MotB domain-containing protein  33.08 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107148  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>