More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0437 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  100 
 
 		 340 aa  683    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1649  OmpA/MotB domain protein  34.3 
 
 		 380 aa  169  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  35.21 
 
 		 361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  33.63 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0404  OmpA/MotB domain protein  32.96 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  34.11 
 
 		 373 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  35.36 
 
 		 373 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  33.15 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  34.4 
 
 		 359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  33.42 
 
 		 373 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  30.41 
 
 		 401 aa  123  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  29.65 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  38.06 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  42.2 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  27.14 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  26.72 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2051  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0438316  hitchhiker  0.0000220927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1898  OmpA/MotB  34.26 
 
 		 198 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1732  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.92 
 
 		 184 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.110246  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  38.68 
 
 		 177 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  26.26 
 
 		 468 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  29.65 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.46 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4671  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 481 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  27.12 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0645  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.14 
 
 		 169 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623294  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  37.37 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  37.19 
 
 		 560 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  32.11 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  32 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  26.92 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  28.27 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  24.77 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  33.99 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1992  OmpA/MotB  36.79 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.779383  normal  0.501686 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  32.3 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  25.84 
 
 		 466 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3118  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.86 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.396871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.58 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1395  OmpA/MotB  31.97 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000229219  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.39 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  36 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2049  OmpA domain-containing protein  37.37 
 
 		 179 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  36.19 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 219 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  27.17 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  33.99 
 
 		 181 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  36.19 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  26.18 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  37.14 
 
 		 177 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 189 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0633  OmpA/MotB domain protein  32.48 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000132054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  32.14 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0263  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein (outer membrane protein P6)  35.71 
 
 		 135 aa  68.2  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000850084  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  35.59 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  25.55 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.91 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.7 
 
 		 671 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3618  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  24.52 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0923  Omp18  36 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.540473  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  39 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1786  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.5 
 
 		 178 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000724127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 218 aa  67  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 218 aa  67  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  36.52 
 
 		 228 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1743  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.5 
 
 		 178 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000604821  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  34.92 
 
 		 352 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1398  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  33.05 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000375397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1747  OmpA domain-containing protein  32.5 
 
 		 178 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000284949  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1250  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  31.62 
 
 		 169 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000441417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  29.61 
 
 		 194 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  35.65 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  35.65 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2867  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  33.05 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.859200000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3086  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  31.62 
 
 		 169 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2955  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  33.05 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000883314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01565  outer membrane protein P6  36.89 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2563  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.54 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637753  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 481 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.91 
 
 		 658 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  25.66 
 
 		 466 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  25.63 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  35.35 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  30.33 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>