More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0633 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0633  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000132054  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  43.23 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1898  OmpA/MotB  42.35 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1992  OmpA/MotB  41.29 
 
 		 195 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.779383  normal  0.501686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.89 
 
 		 658 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1234  OmpA/MotB domain-containing protein  36.73 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455837  normal  0.175097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3597  OmpA/MotB  35.87 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4671  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  29.8 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3719  OmpA/MotB domain-containing protein  32.12 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0404  OmpA/MotB domain protein  31.86 
 
 		 378 aa  68.2  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  34 
 
 		 269 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  29.91 
 
 		 361 aa  67  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  33.03 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  29.91 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  32.79 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  33 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 373 aa  64.7  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1486  OmpA/MotB  27.37 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00178508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 537 aa  61.6  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  32.67 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  32.2 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  32.04 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  32 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1762  OmpA/MotB domain protein  32.67 
 
 		 478 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000778911  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.33 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1649  OmpA/MotB domain protein  28.81 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0693  Omp18  30.71 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0174267  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 		 401 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  32 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  26.4 
 
 		 525 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2141  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 520 aa  58.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0276844  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  30.48 
 
 		 641 aa  58.5  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  27.04 
 
 		 319 aa  58.2  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  29.13 
 
 		 449 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  30.69 
 
 		 294 aa  58.2  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  31.37 
 
 		 364 aa  58.2  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  31 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  25.91 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.85 
 
 		 609 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.13 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  34.95 
 
 		 669 aa  57.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0589  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.66 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000303526  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  27.6 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 316 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.08 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  32 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  29.52 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 		 498 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.07 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  31 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 		 637 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  33.65 
 
 		 434 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2049  OmpA domain-containing protein  31.43 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  42.06 
 
 		 524 aa  55.1  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0466  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  29.13 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  27.18 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 412 aa  54.7  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  29.7 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3080  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.3 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.430069  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 263 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0748  peptidoglycan-associated lipoprotein  28.43 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000605399  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  31.07 
 
 		 271 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  29.36 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  27.18 
 
 		 432 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.13 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  31.37 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  30.39 
 
 		 270 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2804  OmpA/MotB domain-containing protein  28.46 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09021  putative outer membrane protein  36.49 
 
 		 332 aa  53.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111928  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 316 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  31.07 
 
 		 167 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  28.71 
 
 		 261 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  31.73 
 
 		 451 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  28.3 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  32.39 
 
 		 631 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  30.69 
 
 		 166 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  35.58 
 
 		 707 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  31.07 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  30.3 
 
 		 311 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  32.71 
 
 		 235 aa  52.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  31.07 
 
 		 316 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  32.04 
 
 		 316 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  27.27 
 
 		 306 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  29.1 
 
 		 352 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  32.38 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0562  peptidoglycan-associated lipoprotein  27.19 
 
 		 127 aa  52.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00428193  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>