More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1649 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1649  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 380 aa  768    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0404  OmpA/MotB domain protein  55.86 
 
 		 378 aa  292  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  48.04 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  36.21 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  30.87 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  29.52 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  30.48 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  30.02 
 
 		 373 aa  99.8  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  30.79 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  29.47 
 
 		 401 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  28.83 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  33.54 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 225 aa  67  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  33.83 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  34.86 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  32.71 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  33.08 
 
 		 459 aa  62.8  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0682  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  38.53 
 
 		 226 aa  62.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  33.08 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  31.5 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  30.47 
 
 		 626 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  31.13 
 
 		 638 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.38 
 
 		 163 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 227 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  28.47 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  35.78 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1992  OmpA/MotB  30.51 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.779383  normal  0.501686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  32.43 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0633  OmpA/MotB domain protein  27.97 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000132054  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  33.33 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  28.47 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  32.11 
 
 		 670 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  29.01 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 230 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  33.94 
 
 		 263 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  33.94 
 
 		 228 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 230 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  33.64 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  33.94 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 230 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 261 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 222 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  33.94 
 
 		 230 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  31.01 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  35.45 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01565  outer membrane protein P6  34.51 
 
 		 148 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  33.03 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.07 
 
 		 168 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  30.63 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  41.18 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  26.85 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0293  OmpA/MotB domain protein  31.19 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000135813  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  32.11 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  32.11 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  36.19 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  32.73 
 
 		 637 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  41.18 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  34.34 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  35.45 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  30.15 
 
 		 240 aa  57  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.78 
 
 		 220 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.93 
 
 		 658 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 294 aa  57  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  37.21 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  36.7 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  29.92 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  34.62 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  29.23 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  35.05 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  32.26 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  34.86 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0108  peptidoglycan-associated lipoprotein Omp18  32.73 
 
 		 165 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  31.19 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  31.19 
 
 		 216 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3118  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.74 
 
 		 172 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.396871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  32.11 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  26.42 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  38.96 
 
 		 320 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.25 
 
 		 584 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  33.03 
 
 		 167 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0148  peptidoglycan-associated lipoprotein Omp18  32.73 
 
 		 165 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 		 263 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 239 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 219 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>