44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0329 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  100 
 
 
222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  56.92 
 
 
243 aa  249  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  48.74 
 
 
229 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  45.96 
 
 
234 aa  179  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  47.98 
 
 
237 aa  166  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  43.22 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  45.05 
 
 
194 aa  158  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  39.58 
 
 
231 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  42.19 
 
 
227 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  38.84 
 
 
227 aa  128  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  37.74 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  35.07 
 
 
202 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  36.4 
 
 
202 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  34.38 
 
 
215 aa  102  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  35.86 
 
 
190 aa  98.6  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  33.33 
 
 
206 aa  98.6  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  35.19 
 
 
212 aa  98.6  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  33.78 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  35.37 
 
 
195 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  32.14 
 
 
201 aa  92.8  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  34.21 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  33.98 
 
 
190 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  28.21 
 
 
195 aa  88.6  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  28.45 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  30.8 
 
 
209 aa  85.5  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  33.17 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  34.36 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  30.61 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  29.71 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  29.11 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  28.83 
 
 
186 aa  58.9  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1649  OmpA/MotB domain protein  26.42 
 
 
380 aa  55.8  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  28.41 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  31.75 
 
 
181 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  25.26 
 
 
181 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  27.02 
 
 
361 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  29.1 
 
 
373 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  30.71 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  27.95 
 
 
357 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  27.92 
 
 
359 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  30.71 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0404  OmpA/MotB domain protein  30.37 
 
 
378 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  29.45 
 
 
340 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  23.71 
 
 
212 aa  42  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>