More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0720 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  59.52 
 
 		 609 aa  742    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  73.67 
 
 		 607 aa  934    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  100 
 
 		 658 aa  1339    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  45.34 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  47.42 
 
 		 636 aa  399  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  43.86 
 
 		 491 aa  379  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  45.16 
 
 		 633 aa  369  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  45.73 
 
 		 492 aa  361  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  42.6 
 
 		 472 aa  356  5.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  41.36 
 
 		 466 aa  353  5e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  43.22 
 
 		 484 aa  353  8e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.86 
 
 		 471 aa  349  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.37 
 
 		 451 aa  300  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.5 
 
 		 445 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.23 
 
 		 451 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.72 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.84 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  32.39 
 
 		 469 aa  230  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.32 
 
 		 501 aa  227  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.61 
 
 		 475 aa  226  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  30.79 
 
 		 471 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  31.96 
 
 		 574 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  32.69 
 
 		 574 aa  222  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.68 
 
 		 470 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.79 
 
 		 471 aa  219  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.48 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.76 
 
 		 470 aa  219  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.57 
 
 		 472 aa  219  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.57 
 
 		 471 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.57 
 
 		 471 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.05 
 
 		 472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.69 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  30.28 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.98 
 
 		 452 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.89 
 
 		 452 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.05 
 
 		 472 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.25 
 
 		 468 aa  213  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.74 
 
 		 452 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.84 
 
 		 473 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.84 
 
 		 473 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.74 
 
 		 450 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.73 
 
 		 457 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.69 
 
 		 450 aa  209  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.5 
 
 		 441 aa  207  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.89 
 
 		 450 aa  203  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.79 
 
 		 442 aa  203  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  30.34 
 
 		 437 aa  200  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  29.59 
 
 		 445 aa  190  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  29.03 
 
 		 436 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  29.49 
 
 		 436 aa  188  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  32.34 
 
 		 430 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  29.95 
 
 		 425 aa  181  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  29.57 
 
 		 423 aa  181  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  27.5 
 
 		 440 aa  177  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.18 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.84 
 
 		 443 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.27 
 
 		 444 aa  163  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.23 
 
 		 431 aa  161  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.87 
 
 		 450 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0790  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.05 
 
 		 440 aa  153  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000109355  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.98 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.71 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.51 
 
 		 524 aa  137  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.86 
 
 		 519 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.01 
 
 		 456 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.09 
 
 		 475 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.85 
 
 		 456 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0888  ComEC/Rec2 family protein  23.39 
 
 		 559 aa  126  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289662  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.94 
 
 		 467 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  36.81 
 
 		 194 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.32 
 
 		 460 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.89 
 
 		 464 aa  114  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0633  OmpA/MotB domain protein  39.89 
 
 		 198 aa  114  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000132054  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  25.6 
 
 		 472 aa  111  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  24.94 
 
 		 461 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.57 
 
 		 522 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  26.17 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4671  OmpA/MotB domain protein  37.08 
 
 		 205 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  26.27 
 
 		 438 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 204 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.14 
 
 		 518 aa  105  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3597  OmpA/MotB  38.29 
 
 		 193 aa  104  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  25.93 
 
 		 452 aa  103  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.69 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.18 
 
 		 472 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.46 
 
 		 455 aa  99.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.96 
 
 		 428 aa  100  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.87 
 
 		 472 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1992  OmpA/MotB  36.72 
 
 		 195 aa  99.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.779383  normal  0.501686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.82 
 
 		 472 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  24.43 
 
 		 425 aa  99  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  25.19 
 
 		 425 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1898  OmpA/MotB  33.15 
 
 		 198 aa  97.1  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.04 
 
 		 463 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.63 
 
 		 483 aa  94.7  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 		 463 aa  94.7  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.6 
 
 		 487 aa  94.4  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  25.77 
 
 		 451 aa  94  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.44 
 
 		 464 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.19 
 
 		 405 aa  91.7  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>