More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0173 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
364 aa  742    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  65.88 
 
 
361 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0404  OmpA/MotB domain protein  43.24 
 
 
378 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1649  OmpA/MotB domain protein  41.34 
 
 
380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  34.04 
 
 
340 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  33.58 
 
 
373 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  29.59 
 
 
401 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  32.85 
 
 
409 aa  103  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  33.82 
 
 
373 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  26.85 
 
 
357 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  27.88 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  40 
 
 
273 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  42.72 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  36.03 
 
 
613 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2051  OmpA/MotB domain-containing protein  40.31 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0438316  hitchhiker  0.0000220927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4671  OmpA/MotB domain protein  44.04 
 
 
205 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  44.66 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  30.34 
 
 
660 aa  77  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  37.5 
 
 
223 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  36.89 
 
 
481 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 
168 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0633  OmpA/MotB domain protein  30.51 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000132054  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  36.63 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 
242 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  28.36 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  34.59 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  32.14 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  26.85 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  36.5 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  36.36 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  39.05 
 
 
523 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  24.33 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
228 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.64 
 
 
294 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  39.81 
 
 
226 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  33.9 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.48 
 
 
658 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  36.89 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  29.09 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  33.65 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  33.65 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  37.74 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  26.03 
 
 
459 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  39 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  37.76 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 
226 aa  67  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  35.92 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  33.66 
 
 
509 aa  66.6  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  25.31 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  34.95 
 
 
623 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  38.1 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  34.62 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 
264 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3118  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.94 
 
 
172 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.396871  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  36.54 
 
 
260 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  34.62 
 
 
457 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  31.07 
 
 
167 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  24.52 
 
 
468 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3618  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 
185 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266056  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 
227 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  37.86 
 
 
219 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1992  OmpA/MotB  35.96 
 
 
195 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.779383  normal  0.501686 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  37.86 
 
 
219 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
224 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  32.11 
 
 
643 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  32.71 
 
 
671 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3341  OmpA/MotB  36.45 
 
 
170 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5258  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 
170 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  37.86 
 
 
219 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5026  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 
170 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11353  normal  0.0977146 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0108  peptidoglycan-associated lipoprotein Omp18  36.19 
 
 
165 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  36.54 
 
 
260 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 
668 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  35.45 
 
 
402 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  33.01 
 
 
166 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0148  peptidoglycan-associated lipoprotein Omp18  36.19 
 
 
165 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 
218 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 
218 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  32.69 
 
 
498 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 
163 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0120  peptidoglycan-associated lipoprotein Omp18  36.19 
 
 
165 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000178354  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  38.94 
 
 
252 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  33.99 
 
 
243 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  30 
 
 
357 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
200 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>