More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1992 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1992  OmpA/MotB  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.779383  normal  0.501686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4671  OmpA/MotB domain protein  43.01 
 
 		 205 aa  138  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  39.78 
 
 		 204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3597  OmpA/MotB  42.22 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0633  OmpA/MotB domain protein  41.29 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000132054  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3719  OmpA/MotB domain-containing protein  35.82 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  40.61 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1234  OmpA/MotB domain-containing protein  36.95 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455837  normal  0.175097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1898  OmpA/MotB  38.74 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.72 
 
 		 658 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  37.62 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.38 
 
 		 609 aa  70.5  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  45.33 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  37.5 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  37.5 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  26.8 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  37.86 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  47.37 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  33.01 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09021  putative outer membrane protein  37.08 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111928  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  33.98 
 
 		 641 aa  65.5  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 373 aa  65.1  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 		 373 aa  65.1  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1888  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  35.92 
 
 		 919 aa  64.7  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.640223  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 		 215 aa  64.3  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  36.63 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  33.65 
 
 		 364 aa  64.7  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 638 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  42.47 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  34.38 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  36.63 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2203  ompA family protein  34.85 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.505527  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  31.37 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  38.32 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  34.95 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  32.35 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2065  ompA family protein  34.85 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  36.17 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  37.38 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  31.07 
 
 		 620 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  32.35 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  33.98 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  34.95 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  31.16 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 		 543 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2049  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 		 544 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 224 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  30.69 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  35.29 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  31.58 
 
 		 710 aa  62  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  33.68 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.95 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 		 459 aa  61.6  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 317 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 373 aa  61.6  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  30.69 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  32.81 
 
 		 451 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  33.66 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  36.89 
 
 		 509 aa  61.2  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  32.67 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  30.39 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  32.04 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  42.47 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  30.39 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  35.42 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.29 
 
 		 542 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  30.39 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  30.39 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  30.39 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  34.31 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  29.41 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  34.31 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  39.44 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  41.1 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  34.31 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>