More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1898 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1898  OmpA/MotB  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0633  OmpA/MotB domain protein  42.35 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000132054  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  34.03 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1992  OmpA/MotB  38.74 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.779383  normal  0.501686 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  34.48 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1234  OmpA/MotB domain-containing protein  39.69 
 
 		 196 aa  97.8  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455837  normal  0.175097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.15 
 
 		 658 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4671  OmpA/MotB domain protein  37.88 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3719  OmpA/MotB domain-containing protein  34.15 
 
 		 207 aa  91.3  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3597  OmpA/MotB  30.48 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  34.26 
 
 		 340 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  37.37 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1762  OmpA/MotB domain protein  33.56 
 
 		 478 aa  68.2  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000778911  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  30.36 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  31.93 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  33.01 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  40 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  31.31 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  37.62 
 
 		 658 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  31.67 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  36.96 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  32.26 
 
 		 613 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  39.36 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.91 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  30.69 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.91 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.91 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.16 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  31.07 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  33 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 514 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  38.3 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  32.67 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0071  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  40.79 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.91 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0072  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.79 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.524746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  26.58 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  43.42 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  37.38 
 
 		 342 aa  58.5  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  32.67 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1888  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  36 
 
 		 919 aa  58.5  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.640223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  32.99 
 
 		 434 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  29.41 
 
 		 478 aa  58.5  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  31.31 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  29.13 
 
 		 357 aa  58.2  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  37.08 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.38 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  31.13 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0556  OmpA/MotB domain-containing protein  44.74 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1908  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.74 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141022  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  30.69 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  30.77 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  33.66 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  31.13 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  32.67 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  28.16 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  30.93 
 
 		 656 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  32.67 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  28.69 
 
 		 594 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  32.69 
 
 		 149 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 638 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  32.04 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  31.36 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  25.95 
 
 		 631 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0992  OmpA/MotB domain-containing protein  28.71 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2051  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 		 277 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0438316  hitchhiker  0.0000220927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  37.66 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  28.71 
 
 		 620 aa  56.6  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  30.69 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  31 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  31.68 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  25.17 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  29.29 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2026  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor (19 kDa surface antigen) (PPL)  29.91 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2021  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor (19 kDa surface antigen) (PPL)  29.91 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  28.85 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0304  OmpA/MotB domain-containing protein  43.59 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  30.91 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  31 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  30.77 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 		 364 aa  55.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  32.69 
 
 		 648 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  28.03 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  29.7 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 409 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  34.44 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>