More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3719 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3719  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
207 aa  424  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  72.04 
 
 
204 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1992  OmpA/MotB  35.82 
 
 
195 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.779383  normal  0.501686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4671  OmpA/MotB domain protein  36.22 
 
 
205 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  32.98 
 
 
194 aa  91.7  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1898  OmpA/MotB  34.15 
 
 
198 aa  91.3  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.71 
 
 
658 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1234  OmpA/MotB domain-containing protein  34.2 
 
 
196 aa  84  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455837  normal  0.175097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3597  OmpA/MotB  33.33 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0633  OmpA/MotB domain protein  32.12 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000132054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  37.14 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  38.95 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  33.33 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  35.34 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  39.22 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  39.22 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  36 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  36 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  34.33 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  32.56 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  37.17 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  32.5 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.29 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  35.54 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.29 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1908  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.79 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141022  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0556  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  31.25 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  31.63 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  35.71 
 
 
367 aa  65.5  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  34.29 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003912  OmpA precursor  34.03 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  38.68 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  36.54 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  36.54 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  36.54 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  36.54 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  36.54 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  36.54 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  36.54 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  36.54 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  34 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  33.66 
 
 
320 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  28.48 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  34 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  34 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  34 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  34 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  30.46 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  38.66 
 
 
261 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  33.64 
 
 
340 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  34 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  34 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  32.5 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  38.96 
 
 
355 aa  64.3  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  34 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  30.46 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  32.46 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.89 
 
 
172 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  32.76 
 
 
218 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  38.32 
 
 
273 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1314  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.77 
 
 
165 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.4 
 
 
164 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  28.08 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.03 
 
 
609 aa  62.8  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  34 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  31.15 
 
 
227 aa  62.8  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  32.76 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  28.46 
 
 
333 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  27.78 
 
 
478 aa  62.8  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2203  ompA family protein  45.57 
 
 
290 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.505527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  32.35 
 
 
225 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 
215 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3509  OmpA/MotB  32.26 
 
 
164 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140214  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 
239 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  34 
 
 
215 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>