More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0519 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
199 aa  410  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  59.6 
 
 
194 aa  221  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3499  OmpA/MotB  53.27 
 
 
194 aa  205  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  51.26 
 
 
193 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0024  OmpA domain-containing protein  48.48 
 
 
194 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000404844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.32 
 
 
200 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.86 
 
 
199 aa  176  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.49 
 
 
188 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3322  OmpA/MotB domain-containing protein  45.25 
 
 
180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.91 
 
 
185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.71 
 
 
187 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.41 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0293  OmpA/MotB domain protein  39.52 
 
 
204 aa  134  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000135813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  47.33 
 
 
167 aa  134  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  40.43 
 
 
204 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.9 
 
 
190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  53.33 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.38 
 
 
170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.11 
 
 
176 aa  124  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0751  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.89 
 
 
153 aa  124  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000145376  normal  0.0872971 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1911  OmpA domain-containing protein  41.82 
 
 
205 aa  124  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1710  peptidoglycan-associated lipoprotein  50 
 
 
158 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000475645  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0756  OmpA/MotB domain-containing protein  51.43 
 
 
189 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.853822  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0616  peptidoglycan-associated lipoprotein  50 
 
 
171 aa  122  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0805483  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0388  OmpA/MotB  42.96 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0589  peptidoglycan-associated lipoprotein  50.49 
 
 
179 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000303526  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0749  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.06 
 
 
169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000395754  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0615  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  49.52 
 
 
154 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0124381  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0860  OmpA/MotB domain-containing protein  49.06 
 
 
152 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.128552  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3633  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  47.12 
 
 
177 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113835  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0857  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.28 
 
 
155 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000523751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2159  peptidoglycan-associated lipoprotein  50.94 
 
 
173 aa  112  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109799  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0752  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.9 
 
 
169 aa  111  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000800754  normal  0.153168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  45.45 
 
 
170 aa  111  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.43 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.69 
 
 
175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.25 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  49.53 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1039  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  49.06 
 
 
183 aa  108  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.872127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1095  OmpA/MotB  46 
 
 
161 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  45.08 
 
 
169 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  45.08 
 
 
168 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0736  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  43.24 
 
 
172 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6571  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.05 
 
 
167 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.47 
 
 
185 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0225  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.57 
 
 
154 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000120265  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  41.13 
 
 
168 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.94 
 
 
163 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.94 
 
 
163 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0748  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.71 
 
 
153 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000605399  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1943  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.52 
 
 
196 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  41.13 
 
 
168 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  40.94 
 
 
163 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  40.94 
 
 
163 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 
189 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0521  OmpA/MotB domain protein  45.22 
 
 
166 aa  102  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0861  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 
162 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0437517  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1230  OmpA family protein  45.05 
 
 
215 aa  102  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.337438  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  35.6 
 
 
181 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2925  OmpA/MotB  41.09 
 
 
175 aa  101  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.407293  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0466  OmpA/MotB domain-containing protein  49.02 
 
 
203 aa  101  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0729  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.24 
 
 
173 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0152345  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0591  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.4 
 
 
241 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2674  OmpA/MotB  43.4 
 
 
169 aa  101  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267041  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1486  OmpA/MotB  46.53 
 
 
187 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00178508  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1347  putative peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  43.44 
 
 
179 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2160  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.67 
 
 
157 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000805861  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.43 
 
 
163 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1018  OmpA/MotB  43.93 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3849  OmpA/MotB domain-containing protein  36.43 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.44 
 
 
166 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0728  OmpA domain-containing protein  45.61 
 
 
195 aa  99.4  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0826309  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1210  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.44 
 
 
158 aa  99  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240268  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2123  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.79 
 
 
166 aa  99  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.089577  normal  0.358435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  35.57 
 
 
180 aa  99  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.57 
 
 
180 aa  99  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0899  OmpA/MotB  47.52 
 
 
205 aa  99  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025431  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  47 
 
 
163 aa  98.6  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  38.19 
 
 
172 aa  98.6  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2085  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.14 
 
 
178 aa  98.6  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000014342  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  43.44 
 
 
166 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0108  peptidoglycan-associated lipoprotein Omp18  45.71 
 
 
165 aa  98.2  7e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  42.62 
 
 
167 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4401  OmpA/MotB  43.44 
 
 
165 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0685  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.34 
 
 
173 aa  98.2  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.289483 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0120  peptidoglycan-associated lipoprotein Omp18  45.71 
 
 
165 aa  98.2  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000178354  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0148  peptidoglycan-associated lipoprotein Omp18  45.71 
 
 
165 aa  98.2  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125516  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1732  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.98 
 
 
184 aa  98.2  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.110246  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3992  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.44 
 
 
165 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.81 
 
 
177 aa  98.2  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3831  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.44 
 
 
182 aa  98.2  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.44 
 
 
166 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  43.44 
 
 
166 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2049  OmpA domain-containing protein  45.54 
 
 
179 aa  97.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1397  OmpA/MotB  35.37 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1153  OmpA/MotB  40.52 
 
 
181 aa  97.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  39.02 
 
 
177 aa  97.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.44 
 
 
166 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2415  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 
173 aa  97.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.46 
 
 
172 aa  96.7  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>