More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4671 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4671  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 205 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1992  OmpA/MotB  41.38 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.779383  normal  0.501686 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  40.21 
 
 		 204 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1234  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455837  normal  0.175097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3719  OmpA/MotB domain-containing protein  36.76 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.08 
 
 		 658 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1898  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0633  OmpA/MotB domain protein  31.31 
 
 		 198 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000132054  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3597  OmpA/MotB  35.14 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  32.34 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 401 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  36.7 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2051  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0438316  hitchhiker  0.0000220927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  36.61 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  36.45 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1012  OmpA domain-containing protein  28.87 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  33.64 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  28.95 
 
 		 1793 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  33.01 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  33.98 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  34.62 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  35.19 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  41.89 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  29.81 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  28.14 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  41.89 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2081  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0638605  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  32.04 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0563  OmpA/MotB domain-containing protein  29.69 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  28.57 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  32.04 
 
 		 357 aa  58.5  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.05 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  32.69 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  33.94 
 
 		 463 aa  58.2  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0363  outer membrane protein  36.84 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  32.48 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 359 aa  58.2  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  31.31 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  29.63 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  32.32 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  32.69 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  31.19 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  34 
 
 		 412 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 317 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  32.79 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  34.26 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  40.48 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  47.37 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  32.67 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  40.74 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  28.24 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  31.43 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  33 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.08 
 
 		 609 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1375  putative flagellar motor protein (MotB)  30.3 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  39.19 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  34.34 
 
 		 514 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0293  OmpA/MotB domain protein  30.3 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000135813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  30.91 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 487 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  31.48 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  31.68 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  29.81 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  34.95 
 
 		 466 aa  55.5  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  31.48 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  27.21 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  29.81 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  31.48 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  34.29 
 
 		 433 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  35.51 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  34.29 
 
 		 433 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  31.68 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  31.68 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  31.68 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>