More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2085 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3719  OmpA/MotB domain-containing protein  72.04 
 
 		 207 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1992  OmpA/MotB  39.78 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.779383  normal  0.501686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4671  OmpA/MotB domain protein  39.34 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.96 
 
 		 658 aa  104  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  34.39 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1898  OmpA/MotB  34.48 
 
 		 198 aa  99  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1234  OmpA/MotB domain-containing protein  37.57 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455837  normal  0.175097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3597  OmpA/MotB  34.97 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0633  OmpA/MotB domain protein  29.8 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000132054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  43.27 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 409 aa  78.6  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1908  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.57 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  35.45 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 373 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0556  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 373 aa  74.7  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.75 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  35.54 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5131  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.86 
 
 		 609 aa  72.8  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  38.1 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  31.46 
 
 		 228 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.62 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.62 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  33.96 
 
 		 352 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  38.61 
 
 		 273 aa  71.2  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  34.71 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  34.71 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1314  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.19 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  34.71 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  36.6 
 
 		 321 aa  71.2  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  34.71 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  34.71 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  34.71 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  34.71 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  34.71 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  34.71 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.64 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  35.64 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.5 
 
 		 164 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  36.19 
 
 		 149 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  35.87 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.54 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  37.76 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  30.9 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  35.24 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  30.9 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  38.38 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  30.72 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.64 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  33.83 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  41.46 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  41.46 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  35.64 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0304  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  38.84 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  32.04 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.98 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  34.29 
 
 		 266 aa  68.2  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  36.19 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  32.04 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  33.67 
 
 		 318 aa  67.8  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  40.24 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  32.04 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  35.43 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  33.66 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  33.66 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  36.27 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  32.04 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  34.38 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  33.88 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.93 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  36.27 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  33.66 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  33.66 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  33.66 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  31.07 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  33.66 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>