More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0845 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 514 aa  1058    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0023  OmpA  29.04 
 
 		 591 aa  199  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 229 aa  94  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  47.12 
 
 		 229 aa  92.8  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 		 229 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 244 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 218 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  42.31 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  30.89 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  42.31 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  42.31 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  36.57 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  42.31 
 
 		 542 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  41 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  45.54 
 
 		 620 aa  82.8  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  41.28 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  40.4 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  42.72 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  42.72 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  42.72 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 264 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 		 1026 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  35.77 
 
 		 205 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 296 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  29.55 
 
 		 230 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 239 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  29.55 
 
 		 230 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  27.48 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  29.55 
 
 		 230 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  29.55 
 
 		 230 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  42 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  43.27 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  37.21 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3481  OmpA/MotB domain protein  36.9 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  38.02 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  42.86 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  42.86 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 209 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 237 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.5 
 
 		 218 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  36.76 
 
 		 251 aa  76.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  40.78 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  33.58 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  32.1 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  48.57 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05392  hypothetical protein  35.04 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3587  chemotaxis protein MotB  38.05 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  42.31 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.74 
 
 		 609 aa  75.1  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  30.05 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.38 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  39.09 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001456  protein F-related protein  35.65 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  37.88 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  41.84 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  32.09 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  39 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  34.82 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1913  OmpA/MotB  38.61 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467087  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  41.58 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  39.42 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  33.63 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  51.43 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.29 
 
 		 607 aa  73.9  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  33.58 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  32.33 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  40.82 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  45.98 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  43.53 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 310 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  31.58 
 
 		 271 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 576 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  37.86 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  48.57 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  30.18 
 
 		 218 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  38 
 
 		 228 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  52.17 
 
 		 230 aa  73.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 243 aa  73.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  50.72 
 
 		 463 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  42.7 
 
 		 217 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  40.18 
 
 		 648 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  36.19 
 
 		 168 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 263 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 642 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  50.72 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  39.8 
 
 		 333 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 230 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 263 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>