More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1406 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 194 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0633  OmpA/MotB domain protein  43.23 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000132054  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3597  OmpA/MotB  41.53 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.81 
 
 		 658 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1992  OmpA/MotB  40.61 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.779383  normal  0.501686 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1898  OmpA/MotB  34.03 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  34.39 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3719  OmpA/MotB domain-containing protein  32.98 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 364 aa  82.4  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4671  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  40.37 
 
 		 340 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1234  OmpA/MotB domain-containing protein  31.98 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455837  normal  0.175097 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 361 aa  75.1  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 364 aa  75.1  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  39.6 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  37.62 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 420 aa  72.4  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  38.46 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 373 aa  72  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  36.57 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  35.25 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  34.95 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  39.39 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  34.53 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  34.31 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 401 aa  68.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.24 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 466 aa  68.2  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  31.65 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  33.06 
 
 		 316 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  31.93 
 
 		 310 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  31.93 
 
 		 310 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  37.78 
 
 		 266 aa  68.2  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  32.77 
 
 		 320 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  31.93 
 
 		 310 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  31.93 
 
 		 310 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  35.48 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  31.93 
 
 		 310 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  39.05 
 
 		 464 aa  67.8  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  33.06 
 
 		 316 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  37.25 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  31.93 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  37.25 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  37.25 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  35.29 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  35.92 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  37.25 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  31.93 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  37.25 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  34.31 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  37.25 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  32.23 
 
 		 316 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  37.25 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  32.04 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  37.25 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  37.25 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  32.23 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  32.23 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  35.29 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  35.51 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  38.24 
 
 		 434 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  32.23 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  32.09 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 729 aa  65.5  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  32.04 
 
 		 620 aa  65.5  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  36.27 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0404  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 		 378 aa  64.7  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 239 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  39 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  36.27 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>