More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2839 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 471 aa  882    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  36.57 
 
 		 560 aa  163  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  35.68 
 
 		 477 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.3 
 
 		 356 aa  94.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  48.25 
 
 		 534 aa  90.5  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  41.73 
 
 		 355 aa  88.2  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1463  OmpA/MotB domain protein  50.43 
 
 		 193 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.33 
 
 		 521 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  34.72 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  34.72 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  50.46 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  38.52 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  38.21 
 
 		 212 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 227 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  44.44 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  33.68 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  34.76 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  35.51 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.12 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.52 
 
 		 220 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  43.93 
 
 		 264 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  38.68 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  46.28 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1203  OmpA/MotB domain-containing protein  45.52 
 
 		 193 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.232705 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  45.95 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 219 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  44.04 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3892  OmpA/MotB domain protein  42.74 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.2 
 
 		 199 aa  76.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  45.87 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  37.27 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0659  outer membrane protein, OmpA family  34.09 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  44.66 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 168 aa  75.1  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  45.87 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0293  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000135813  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  45.87 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  35.71 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  39.02 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  34.56 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  40.16 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  41.88 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  34.56 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  42.73 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.57 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  38.21 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  39.82 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  44.53 
 
 		 269 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.39 
 
 		 180 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  37.4 
 
 		 209 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 242 aa  73.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  33.08 
 
 		 217 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  44.53 
 
 		 269 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  41.44 
 
 		 266 aa  72.8  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.27 
 
 		 200 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0589  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.28 
 
 		 179 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000303526  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  45.11 
 
 		 270 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.18 
 
 		 199 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  38.39 
 
 		 180 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  40 
 
 		 222 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0615  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 229 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  34.68 
 
 		 225 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  35.45 
 
 		 214 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  44.95 
 
 		 220 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 224 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 220 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  45.13 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  30.94 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 		 187 aa  71.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  37.62 
 
 		 177 aa  71.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  34.19 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  35.19 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  30.94 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.14 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1012  OmpA domain-containing protein  36.45 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  34.53 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  31.53 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2049  OmpA domain-containing protein  37.62 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  35.04 
 
 		 236 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  34.29 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  39.42 
 
 		 340 aa  69.7  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1985  OmpA/MotB  32.89 
 
 		 180 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188603  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  43.24 
 
 		 334 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  40.48 
 
 		 481 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  33.96 
 
 		 403 aa  69.7  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  43.14 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>