More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1463 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1463  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
193 aa  377  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.373103  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1203  OmpA/MotB domain-containing protein  57.58 
 
 
193 aa  203  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.232705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.24 
 
 
356 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  43.64 
 
 
560 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  35.2 
 
 
200 aa  96.3  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1340  Outer membrane protein and related peptidoglycan- associated (lipo)protein-like protein  42.75 
 
 
535 aa  91.7  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.298115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 
176 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  44.3 
 
 
471 aa  87  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.88 
 
 
521 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.84 
 
 
217 aa  82  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  35.48 
 
 
252 aa  82  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  36.1 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  45.04 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  37.01 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 
534 aa  78.2  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  42.34 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  42.34 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  42.28 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  36.72 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  36.57 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  39.17 
 
 
239 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  33.56 
 
 
263 aa  72  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  42.2 
 
 
231 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  38.52 
 
 
477 aa  71.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 
219 aa  71.2  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  39.5 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  39.5 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  38.81 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  43.24 
 
 
509 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  38.02 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05164  hypothetical protein  27.96 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.02 
 
 
240 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  37.9 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  39.67 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.48 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  38.21 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  37.1 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  33.55 
 
 
420 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  36.84 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3892  OmpA/MotB domain protein  35.2 
 
 
365 aa  65.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309252  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  35.96 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0727  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  34.33 
 
 
367 aa  65.5  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  41.88 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 
376 aa  65.1  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.32 
 
 
607 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  41.18 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  39.53 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  41.27 
 
 
296 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  38.14 
 
 
243 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  38.02 
 
 
430 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0842  outer membrane protein  38.79 
 
 
273 aa  64.3  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0308404  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  37.5 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  35.09 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 
224 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 
220 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2977  OmpA/MotB domain protein  40.87 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  37.1 
 
 
241 aa  62.8  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  36.51 
 
 
208 aa  62.8  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  35.77 
 
 
228 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  35.77 
 
 
228 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  37.5 
 
 
226 aa  62.4  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  33.55 
 
 
481 aa  62  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  33.87 
 
 
222 aa  62  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  38.39 
 
 
345 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.04 
 
 
345 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 
228 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  37.9 
 
 
218 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  37.01 
 
 
224 aa  61.2  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  37.5 
 
 
223 aa  61.2  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  38.58 
 
 
228 aa  61.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 
276 aa  61.2  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  37.04 
 
 
344 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  37.04 
 
 
344 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  37.04 
 
 
344 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  34.38 
 
 
224 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 
344 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  37.9 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 
239 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  39.02 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2434  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 
507 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  48.1 
 
 
217 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 
359 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  34.85 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0659  outer membrane protein, OmpA family  34.26 
 
 
307 aa  60.1  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  34.68 
 
 
230 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  36.07 
 
 
321 aa  59.7  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>