More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05164 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05164  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  625  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0659  outer membrane protein, OmpA family  56.07 
 
 		 307 aa  329  3e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  34.17 
 
 		 457 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  32.49 
 
 		 466 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  29.87 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  29.44 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  29.87 
 
 		 454 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  28.14 
 
 		 468 aa  95.9  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  27.27 
 
 		 466 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  43.12 
 
 		 212 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 218 aa  87  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 		 218 aa  87  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  43.64 
 
 		 219 aa  85.9  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  42.2 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  42.86 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  42.86 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  28.4 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  37.29 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  46.94 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.79 
 
 		 607 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  43 
 
 		 669 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  49.32 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  33.91 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  49.32 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  32.26 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  38.39 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  45 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  40.2 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  40.2 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  40.2 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  40.2 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  40.2 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  40.2 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  40.2 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  40.2 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  40.2 
 
 		 358 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  39.22 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  39.22 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  39.22 
 
 		 179 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  39.22 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  39.22 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  39.22 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  46.58 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.29 
 
 		 609 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  39.22 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  46.58 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.34 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  44.71 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  43.18 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  38.24 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  44.71 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.78 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  44.71 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0727  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  38.38 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  43.53 
 
 		 369 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  41.41 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  31.34 
 
 		 1793 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  30.5 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.36 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  42.35 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  36.73 
 
 		 166 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0728  OmpA domain-containing protein  40.38 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0826309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  41.18 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  41.41 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  33.57 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  36.04 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  36.73 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  32.41 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  39.58 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  36.73 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  37.11 
 
 		 217 aa  67  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  37.11 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.73 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  36.73 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>