More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2977 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2977  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
198 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  43.13 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  45.61 
 
 
176 aa  94.7  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  51.35 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  47.79 
 
 
430 aa  84.7  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 
296 aa  81.3  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  43.24 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  32.1 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  42.34 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  51.33 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  40.17 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  38.33 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  40.3 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 
679 aa  75.1  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.72 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  35.38 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  39.34 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  44.26 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
230 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  38.39 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  37.96 
 
 
261 aa  71.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  38 
 
 
331 aa  71.6  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  46.09 
 
 
560 aa  71.2  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.74 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  40.18 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  37.61 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  39.66 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  39.13 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  39.66 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  34.71 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4096  OmpA/MotB domain protein  47.75 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287994  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  39.47 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.74 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  39.47 
 
 
345 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  40.17 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  39.47 
 
 
344 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.32 
 
 
521 aa  68.6  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  39.47 
 
 
344 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 
534 aa  68.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  38.74 
 
 
344 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  40 
 
 
407 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  31.68 
 
 
477 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  42.98 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  38.84 
 
 
261 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  39.47 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  40 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  35.2 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  34.88 
 
 
166 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  35.94 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  38.84 
 
 
261 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  41.38 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  43.93 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  39.64 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  39.64 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 
362 aa  65.9  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  43.86 
 
 
481 aa  65.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  43.93 
 
 
334 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  38.6 
 
 
344 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  39.81 
 
 
365 aa  65.5  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  36.36 
 
 
365 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  35.48 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.6 
 
 
344 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  36.36 
 
 
358 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  36.36 
 
 
346 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  36.36 
 
 
346 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  36.36 
 
 
350 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  31.97 
 
 
230 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  36.36 
 
 
346 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  37.74 
 
 
337 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  32.2 
 
 
269 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  38.18 
 
 
327 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  36.36 
 
 
354 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  36.36 
 
 
346 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  36.36 
 
 
346 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  33.91 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 
247 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  43.48 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  39.45 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 
240 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 
242 aa  63.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  36.36 
 
 
350 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>