More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1564 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  100 
 
 		 521 aa  1044    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  68.35 
 
 		 534 aa  704    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  35.44 
 
 		 477 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  31.19 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  31.19 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  40.8 
 
 		 200 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1463  OmpA/MotB domain protein  42.25 
 
 		 193 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  42.61 
 
 		 200 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 		 218 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 218 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  32.56 
 
 		 188 aa  78.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 		 219 aa  79.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  43.33 
 
 		 560 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  38.94 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 537 aa  77  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  35.07 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40.68 
 
 		 240 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  41.88 
 
 		 217 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  39.67 
 
 		 237 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 239 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  37.11 
 
 		 217 aa  75.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  28.21 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  36.44 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  38.94 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  38.52 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  34.85 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  34.85 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  40.17 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  34.59 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1445  hypothetical protein  85.71 
 
 		 116 aa  74.3  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186407  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.72 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  41.59 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  42.74 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  33.63 
 
 		 187 aa  73.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  39.45 
 
 		 231 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  35.4 
 
 		 212 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  35.65 
 
 		 214 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  39.68 
 
 		 176 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1340  Outer membrane protein and related peptidoglycan- associated (lipo)protein-like protein  39.69 
 
 		 535 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 244 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  39.06 
 
 		 228 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  33.78 
 
 		 263 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.57 
 
 		 447 aa  72  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.46 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  40.91 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  38.89 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  33.61 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  33.61 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  33.61 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  33.61 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  33.61 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3892  OmpA/MotB domain protein  35.42 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  33.61 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  33.61 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  35.25 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  33.61 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  35.25 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  33.61 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  40.37 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  36.51 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  33.91 
 
 		 210 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 		 362 aa  69.7  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.5 
 
 		 351 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  36.51 
 
 		 217 aa  70.1  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 224 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  36 
 
 		 218 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  38.28 
 
 		 228 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  34.71 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  38.02 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 		 229 aa  68.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  37.19 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  32.87 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  34.65 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2977  OmpA/MotB domain protein  39.32 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  34.4 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  38.39 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  34.25 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  39.74 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.61 
 
 		 607 aa  67.4  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  32.76 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  33.67 
 
 		 222 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  33.67 
 
 		 222 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.4 
 
 		 222 aa  67  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  33.67 
 
 		 222 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  31.4 
 
 		 222 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.04 
 
 		 344 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  35.54 
 
 		 236 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 		 220 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  35.71 
 
 		 224 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  37.93 
 
 		 220 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  34.88 
 
 		 509 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>