More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5365 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  68.35 
 
 
521 aa  708    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
534 aa  1073    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 
477 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 
200 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  48.25 
 
 
471 aa  90.1  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 
200 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  40.48 
 
 
176 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  41.79 
 
 
217 aa  82  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  43.48 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  43.1 
 
 
560 aa  80.1  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  40 
 
 
217 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  40.71 
 
 
219 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1463  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 
193 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.373103  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  45.3 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  40.83 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  28.08 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  42.37 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  43.44 
 
 
235 aa  75.5  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  37.86 
 
 
221 aa  75.5  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  41.18 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  40.52 
 
 
430 aa  75.1  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.5 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  37.07 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  37.1 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.17 
 
 
607 aa  73.6  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.33 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  34.75 
 
 
219 aa  72.8  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  37.75 
 
 
220 aa  73.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 
242 aa  73.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  34.78 
 
 
228 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  35.61 
 
 
228 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  35.61 
 
 
228 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  35.61 
 
 
228 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  40.74 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  36.52 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  35.83 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  33.58 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  36.28 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  37.5 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  33.82 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  38.4 
 
 
221 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  33.81 
 
 
263 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 
537 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  34.48 
 
 
214 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  34.06 
 
 
228 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  33.33 
 
 
223 aa  68.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  33.62 
 
 
210 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 
189 aa  69.3  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  34.19 
 
 
187 aa  68.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 
243 aa  68.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  33.57 
 
 
225 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  31.06 
 
 
188 aa  68.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  36.67 
 
 
227 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2977  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  45.68 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  32.14 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  37.17 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3892  OmpA/MotB domain protein  36.42 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309252  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  34.43 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  36.59 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  34.96 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  34.92 
 
 
205 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  37.72 
 
 
420 aa  67  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  36.59 
 
 
222 aa  67  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  37.63 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  37.63 
 
 
371 aa  67  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  39.45 
 
 
231 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  37.63 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  37.9 
 
 
224 aa  66.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  38.26 
 
 
350 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  37.9 
 
 
217 aa  66.6  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  37.63 
 
 
358 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  38.26 
 
 
350 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 
179 aa  66.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  33.61 
 
 
346 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  38.18 
 
 
466 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  37.1 
 
 
220 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  34.96 
 
 
228 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  37.5 
 
 
270 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  33.61 
 
 
346 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  33.61 
 
 
354 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  33.61 
 
 
346 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  33.61 
 
 
346 aa  65.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  34.96 
 
 
230 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  36.52 
 
 
351 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  34.96 
 
 
230 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 
224 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
225 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>