More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2281 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  100 
 
 		 356 aa  722    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1340  Outer membrane protein and related peptidoglycan- associated (lipo)protein-like protein  32.46 
 
 		 535 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1463  OmpA/MotB domain protein  44.03 
 
 		 193 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  31.3 
 
 		 355 aa  96.3  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  31.3 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  34.84 
 
 		 270 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  25.52 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1203  OmpA/MotB domain-containing protein  35.98 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.232705 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  38.81 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  46.23 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  28.84 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  36.43 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  42.2 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  39.09 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  39.64 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.76 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 		 216 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  45.28 
 
 		 216 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  37.1 
 
 		 176 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  43.86 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  42.52 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  39.64 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  41.07 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  38.74 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  43.64 
 
 		 607 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2804  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  37.17 
 
 		 481 aa  76.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  33.33 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  41.07 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  41.07 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  40 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  34.13 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  37.82 
 
 		 270 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  40.87 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  40 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 165 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.09 
 
 		 240 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  39.64 
 
 		 222 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  38.52 
 
 		 217 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 		 270 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  27.06 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 		 231 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  42.06 
 
 		 221 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0742  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  41.35 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.666239  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.72 
 
 		 521 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  38.26 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.29 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  31.54 
 
 		 189 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4321  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.82 
 
 		 605 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 631 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  37.72 
 
 		 161 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  41.35 
 
 		 890 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  38.18 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  30.05 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  38.06 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  39.29 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  36.07 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  36.44 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  44.23 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  39.29 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2977  OmpA/MotB domain protein  33.72 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  39.17 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  37.93 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  39.66 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  39.82 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  37.72 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 416 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  36.07 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 239 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 587 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  36.07 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  35.59 
 
 		 170 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  36.07 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 239 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 499 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>