More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0704 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
217 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2977  OmpA/MotB domain protein  59.65 
 
 
198 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  47.2 
 
 
200 aa  101  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  44.29 
 
 
176 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  38.89 
 
 
252 aa  94.7  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  34.34 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  40.29 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  39.39 
 
 
477 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.62 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  41.79 
 
 
534 aa  82  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  42.2 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  43.59 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  41.8 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  41.8 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  44.25 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  43.33 
 
 
331 aa  78.6  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.52 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  43.44 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 
219 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  40.7 
 
 
261 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  40.7 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  39.2 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  47.01 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  37.3 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  38.4 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  46.49 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.11 
 
 
521 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  46.49 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  46.49 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  40 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 
264 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  45.69 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  41.46 
 
 
358 aa  75.1  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  44.83 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  44.83 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  44.83 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.83 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.6 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  36.78 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  40.98 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  36.99 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  38.84 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  38.84 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  38.84 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  36.78 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  38.84 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  38.84 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  38.84 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  38.84 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  38.84 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  38.84 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  38.84 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  39.55 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  38.41 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  29.95 
 
 
679 aa  72.4  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3406  OmpA/MotB domain-containing protein  40.68 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  38.84 
 
 
358 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  42.24 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  38.84 
 
 
358 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  40.52 
 
 
229 aa  72  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  38.84 
 
 
371 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.52 
 
 
218 aa  72  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  38.84 
 
 
369 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  33.56 
 
 
514 aa  72  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  45.61 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  36.92 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0727  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.38 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  41.23 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  37.29 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  39.2 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  39.66 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0615  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  36.72 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  40.35 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  39.2 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  38.21 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  38.02 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  41.91 
 
 
560 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  44.44 
 
 
481 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  40.52 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 
499 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  41.74 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  38.4 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  39.2 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  44.25 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.59 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  38.41 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>