More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2940 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  100 
 
 		 648 aa  1208    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  56.94 
 
 		 525 aa  336  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  57.23 
 
 		 525 aa  334  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  55.63 
 
 		 463 aa  317  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  56.65 
 
 		 525 aa  316  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  61.24 
 
 		 799 aa  294  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  63.27 
 
 		 784 aa  287  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  43.12 
 
 		 343 aa  230  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  41.84 
 
 		 343 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  44.38 
 
 		 342 aa  227  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  41.72 
 
 		 343 aa  223  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  42.68 
 
 		 343 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  41.72 
 
 		 343 aa  221  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  43.56 
 
 		 343 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  48.23 
 
 		 375 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  44.76 
 
 		 314 aa  200  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  47.01 
 
 		 341 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  41.64 
 
 		 340 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  46.15 
 
 		 341 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  41.06 
 
 		 343 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  45.3 
 
 		 345 aa  196  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  41.39 
 
 		 342 aa  195  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  47.81 
 
 		 341 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  43.01 
 
 		 342 aa  190  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  46.15 
 
 		 341 aa  187  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 362 aa  182  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 337 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  43.97 
 
 		 342 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  42.8 
 
 		 337 aa  178  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 		 337 aa  177  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 		 337 aa  177  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  42.29 
 
 		 337 aa  176  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  38.23 
 
 		 374 aa  176  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  41.2 
 
 		 337 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  40.68 
 
 		 326 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  41.7 
 
 		 338 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  41.85 
 
 		 337 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  40.07 
 
 		 329 aa  169  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 348 aa  153  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  38.5 
 
 		 427 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  44.26 
 
 		 287 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 		 256 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  31.85 
 
 		 289 aa  107  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  35.94 
 
 		 292 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 		 257 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 290 aa  101  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  42.24 
 
 		 299 aa  100  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  37.22 
 
 		 266 aa  100  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 261 aa  97.1  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  40.87 
 
 		 257 aa  96.3  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  38.85 
 
 		 248 aa  95.9  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  31.3 
 
 		 280 aa  96.3  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 259 aa  94  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  42.37 
 
 		 266 aa  94  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  37.39 
 
 		 265 aa  93.6  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 245 aa  93.6  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  40 
 
 		 285 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  36.23 
 
 		 321 aa  92.8  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  43.59 
 
 		 285 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  38.21 
 
 		 179 aa  90.5  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  28.95 
 
 		 314 aa  90.5  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.82 
 
 		 263 aa  90.5  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  30.29 
 
 		 291 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  42.74 
 
 		 285 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  35.98 
 
 		 275 aa  90.1  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  32.41 
 
 		 269 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  39.34 
 
 		 242 aa  88.6  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  34.78 
 
 		 261 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  42.74 
 
 		 285 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  34.18 
 
 		 323 aa  88.2  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  34.51 
 
 		 271 aa  88.2  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 		 271 aa  87.8  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  41.38 
 
 		 338 aa  87.4  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  38.14 
 
 		 286 aa  87  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0148  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 		 258 aa  87  8e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 		 307 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  38.6 
 
 		 256 aa  87  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 		 236 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 		 285 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  36.52 
 
 		 238 aa  85.9  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  40.52 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  34.65 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  34.15 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  34.15 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  34.96 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  36.59 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  34.96 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  40 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4407  chemotaxis protein motB, C-terminus  37.6 
 
 		 156 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  36.72 
 
 		 268 aa  83.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  33.91 
 
 		 261 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  34.21 
 
 		 251 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  34.15 
 
 		 262 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  38.36 
 
 		 269 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  33.91 
 
 		 261 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  38.28 
 
 		 267 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.76 
 
 		 259 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>