More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2208 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  87.62 
 
 
525 aa  764    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  100 
 
 
525 aa  994    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  87.81 
 
 
525 aa  743    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  52.72 
 
 
463 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  56.59 
 
 
648 aa  326  5e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  63.53 
 
 
799 aa  297  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  61.92 
 
 
784 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  40.9 
 
 
343 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  47.62 
 
 
343 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  48.5 
 
 
342 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  40 
 
 
343 aa  226  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  48.48 
 
 
343 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  40.06 
 
 
343 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  42.26 
 
 
343 aa  220  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  50 
 
 
375 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  40.6 
 
 
341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  39.4 
 
 
342 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  39.1 
 
 
343 aa  208  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  41.53 
 
 
341 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  40.9 
 
 
341 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  37.91 
 
 
342 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  43.94 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  40.3 
 
 
340 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 
427 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  37.61 
 
 
314 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  44.06 
 
 
362 aa  197  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  40.6 
 
 
341 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  46.55 
 
 
329 aa  194  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  42.63 
 
 
337 aa  194  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  42.63 
 
 
337 aa  194  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
337 aa  193  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
337 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  39.7 
 
 
337 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 
337 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  38.85 
 
 
348 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
338 aa  186  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 
337 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  41.92 
 
 
326 aa  180  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  41.13 
 
 
342 aa  179  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 
374 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  39.19 
 
 
256 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  38.22 
 
 
287 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 
266 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  43.22 
 
 
275 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  32.34 
 
 
280 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  45.83 
 
 
269 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  29.57 
 
 
321 aa  100  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  40 
 
 
179 aa  97.1  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 
280 aa  97.1  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  33.78 
 
 
291 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
254 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  39.5 
 
 
290 aa  95.5  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  38.84 
 
 
289 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  37.39 
 
 
271 aa  95.1  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  38.69 
 
 
299 aa  94.4  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  40.5 
 
 
292 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  37.82 
 
 
257 aa  93.2  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 
266 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 
258 aa  92.8  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 
253 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  42.98 
 
 
249 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  33.16 
 
 
288 aa  91.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  41.23 
 
 
268 aa  91.3  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  36.44 
 
 
236 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  27.24 
 
 
314 aa  90.5  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  43.86 
 
 
257 aa  90.9  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  32.14 
 
 
271 aa  90.1  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  30.18 
 
 
245 aa  89  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  45.45 
 
 
267 aa  87.8  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
242 aa  88.2  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3029  hypothetical protein  39.68 
 
 
217 aa  87.4  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  32.09 
 
 
248 aa  87  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  35.65 
 
 
266 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  39.52 
 
 
267 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
307 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  28.52 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2921  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 
277 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751625  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  34.54 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 
248 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  32.12 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  37.39 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  31.86 
 
 
271 aa  84  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1013  OmpA/MotB domain-containing protein  40.16 
 
 
244 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1539  motB protein, putative  38.33 
 
 
245 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.198619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3481  OmpA/MotB domain protein  32.52 
 
 
282 aa  84  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 
238 aa  83.2  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
275 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  40.46 
 
 
305 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2377  OmpA/MotB domain protein  35.56 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447675  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  43.1 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27640  Flagellar motor protein  41.8 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  42.67 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  37.93 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  36.07 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  48.75 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  39.66 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 
275 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  40.65 
 
 
290 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.4 
 
 
263 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>