More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4488 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  94.13 
 
 		 341 aa  634    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  89.44 
 
 		 341 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  86.8 
 
 		 341 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  81.87 
 
 		 342 aa  565  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  81.29 
 
 		 343 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  80.41 
 
 		 342 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  62.1 
 
 		 343 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  60.93 
 
 		 343 aa  425  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  63.19 
 
 		 343 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  61.7 
 
 		 340 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  60.06 
 
 		 342 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  58.89 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  62.69 
 
 		 337 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  57.43 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  59.3 
 
 		 345 aa  388  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  62.09 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  58.89 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  59.06 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  56.56 
 
 		 314 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  60 
 
 		 337 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  59.06 
 
 		 337 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  59.06 
 
 		 337 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  59.06 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  56.98 
 
 		 338 aa  342  8e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  46.76 
 
 		 375 aa  315  8e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  50.42 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  50.15 
 
 		 329 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  44.38 
 
 		 374 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  43.82 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  43.45 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  41.69 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  57.02 
 
 		 427 aa  245  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  46.78 
 
 		 525 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  46.78 
 
 		 525 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  46.78 
 
 		 525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  47.97 
 
 		 799 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  46.15 
 
 		 648 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  44.81 
 
 		 463 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  44.49 
 
 		 784 aa  189  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  32.89 
 
 		 256 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  44.07 
 
 		 290 aa  93.2  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  29.75 
 
 		 289 aa  92.8  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  29.96 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  43.1 
 
 		 257 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  31.92 
 
 		 245 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0967  OmpA/MotB domain protein  39.68 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 290 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 		 261 aa  85.9  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  45.76 
 
 		 272 aa  86.3  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  43.36 
 
 		 249 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 271 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  47.41 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  28.51 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  40.8 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  37.9 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  40.87 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  44.83 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  30 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  28.64 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  39.17 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  38.98 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  33.88 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  38.41 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  38.6 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  27.86 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  29.19 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  31.9 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  28.14 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  40.52 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  28.14 
 
 		 225 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  28.14 
 
 		 225 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  28.14 
 
 		 225 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  28.14 
 
 		 225 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 		 266 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  28.14 
 
 		 225 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  28.74 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  37.41 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  35.9 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  33.07 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  37.5 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1016  OmpA/MotB  41.27 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.436254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  37.61 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  38.6 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  33.07 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04090  hypothetical protein  35.5 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  36.89 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>