More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3542 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  93.27 
 
 		 342 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  684    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  86.26 
 
 		 342 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  82.75 
 
 		 341 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  83.33 
 
 		 341 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  85.67 
 
 		 341 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  81.29 
 
 		 341 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  62.57 
 
 		 340 aa  434  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  61.22 
 
 		 343 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  64.18 
 
 		 337 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  60.06 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  60.06 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  60.93 
 
 		 343 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  62.39 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  59.18 
 
 		 342 aa  398  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  58.55 
 
 		 343 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  60.64 
 
 		 343 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  58.43 
 
 		 345 aa  388  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  58.77 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  61.19 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  62.09 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  60.53 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  60.53 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  53.94 
 
 		 314 aa  360  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  55.81 
 
 		 338 aa  339  5e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  47.03 
 
 		 375 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  43.65 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  48.82 
 
 		 329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  45.86 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  41.11 
 
 		 348 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  56.16 
 
 		 427 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  47.81 
 
 		 525 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  47.81 
 
 		 525 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  46.05 
 
 		 525 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  44.9 
 
 		 784 aa  199  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  44.49 
 
 		 799 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  43.38 
 
 		 648 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  46.67 
 
 		 463 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  33.49 
 
 		 245 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  38.84 
 
 		 271 aa  96.3  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  45.95 
 
 		 249 aa  95.9  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  43.1 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  33.83 
 
 		 256 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  29.92 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  29.04 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  39.32 
 
 		 275 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 288 aa  90.1  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  30.65 
 
 		 225 aa  90.1  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  39.52 
 
 		 179 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  47.47 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  40 
 
 		 256 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  40.17 
 
 		 244 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  42.02 
 
 		 290 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  39.83 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  40.35 
 
 		 267 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  38.94 
 
 		 268 aa  87  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  37.82 
 
 		 269 aa  86.3  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  31.36 
 
 		 266 aa  86.7  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 271 aa  86.3  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  28.78 
 
 		 225 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  28.78 
 
 		 225 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  41.38 
 
 		 266 aa  85.9  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  41.38 
 
 		 223 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 223 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 228 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  39.32 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  29.59 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  41.23 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  29.59 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  41.23 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  28.69 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  37.41 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  29.59 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  29.59 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  29.59 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  29.59 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  30.86 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  29.59 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  41.53 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.94 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  35.59 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 258 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0967  OmpA/MotB domain protein  37.82 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  39.67 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  37.59 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.48 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  41.12 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  29.9 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0148  OmpA/MotB domain protein  37.29 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  42.61 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  36.8 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>