More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1073 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  731    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  48.39 
 
 		 343 aa  338  7e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  48.13 
 
 		 343 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  47.47 
 
 		 345 aa  338  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  46.9 
 
 		 342 aa  328  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  47.04 
 
 		 343 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  47.33 
 
 		 342 aa  325  9e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  46.95 
 
 		 343 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  47.03 
 
 		 343 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  45.43 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  47.45 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  47.2 
 
 		 340 aa  319  6e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  46.49 
 
 		 342 aa  318  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  46.49 
 
 		 341 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  47.73 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  47.04 
 
 		 343 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  42.93 
 
 		 427 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  48 
 
 		 337 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  48.38 
 
 		 341 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  46.97 
 
 		 374 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  48 
 
 		 337 aa  306  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  46.76 
 
 		 341 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  48.52 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  47.34 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  48.53 
 
 		 337 aa  300  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  48.53 
 
 		 337 aa  300  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  46.63 
 
 		 337 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  44 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  41.4 
 
 		 314 aa  278  8e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  44.08 
 
 		 329 aa  266  5e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 342 aa  247  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  36.15 
 
 		 463 aa  223  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  50.86 
 
 		 525 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  50 
 
 		 525 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  50 
 
 		 525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  46.94 
 
 		 784 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  48.23 
 
 		 648 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  48.76 
 
 		 799 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  51.33 
 
 		 249 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  36.24 
 
 		 256 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  29.96 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  39.1 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  33.67 
 
 		 245 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  43.97 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  43.97 
 
 		 266 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  45.61 
 
 		 338 aa  96.3  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  35.25 
 
 		 259 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 288 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  41.88 
 
 		 281 aa  94.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  34.06 
 
 		 271 aa  94.4  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  42.61 
 
 		 256 aa  94  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  43.41 
 
 		 305 aa  93.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  31.42 
 
 		 299 aa  93.6  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 		 280 aa  93.2  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  37.9 
 
 		 179 aa  92.8  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  42.96 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  42.74 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 291 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  29.1 
 
 		 287 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  28.79 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  35.42 
 
 		 257 aa  90.9  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  40.71 
 
 		 268 aa  90.5  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  40 
 
 		 257 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.56 
 
 		 263 aa  89.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  39.67 
 
 		 290 aa  89.7  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 		 269 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 242 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  34.01 
 
 		 225 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  33.86 
 
 		 259 aa  87.8  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 266 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  38 
 
 		 286 aa  87  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 228 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 223 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  39.84 
 
 		 266 aa  85.9  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 253 aa  86.3  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 254 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  37.07 
 
 		 238 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 271 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 223 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  32.74 
 
 		 307 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  41.38 
 
 		 223 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2456  hypothetical protein  37.13 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  32.07 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  35.59 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  40.59 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  35.03 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  43.86 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  35.06 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4485  hypothetical protein  41.73 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.593276  normal  0.69449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  38.6 
 
 		 266 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  42.99 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  40.65 
 
 		 269 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>