More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3431 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  100 
 
 
295 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  95.25 
 
 
295 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  78.57 
 
 
296 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  79.71 
 
 
285 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  79.35 
 
 
285 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  78.99 
 
 
285 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  78.62 
 
 
285 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  65.66 
 
 
296 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  64.98 
 
 
296 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  66.19 
 
 
269 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  48.3 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  43.17 
 
 
286 aa  229  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  44.72 
 
 
288 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 
305 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  41.88 
 
 
338 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  44.14 
 
 
288 aa  203  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  41.88 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  39.93 
 
 
305 aa  192  7e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  42.13 
 
 
263 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  39.84 
 
 
267 aa  175  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  39.29 
 
 
273 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  41.38 
 
 
257 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  38.98 
 
 
273 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  34.72 
 
 
271 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1525  putative chemotaxis MotB protein  36.15 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  34.5 
 
 
266 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  34.25 
 
 
271 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  35.74 
 
 
261 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  37.45 
 
 
257 aa  152  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  35.34 
 
 
244 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.59 
 
 
263 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  38.04 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3422  OmpA/MotB domain-containing protein  37.7 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402253  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  33.95 
 
 
271 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  31.71 
 
 
253 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  32.96 
 
 
280 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  33.2 
 
 
254 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  35.12 
 
 
249 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  34.96 
 
 
238 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  35.94 
 
 
281 aa  142  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  34.93 
 
 
269 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  34.77 
 
 
258 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  32.67 
 
 
267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  31.89 
 
 
271 aa  136  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  34.87 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  32.66 
 
 
256 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  30.58 
 
 
245 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  33.46 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  34.06 
 
 
290 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  31.2 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  32.44 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  32.03 
 
 
236 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  30.8 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  30.59 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  31.2 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  29.25 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  31.91 
 
 
251 aa  115  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  29.34 
 
 
262 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  31.98 
 
 
323 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  29.15 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  29.34 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  27.31 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  29.15 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  29.39 
 
 
290 aa  112  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  28.74 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1375  putative flagellar motor protein (MotB)  29.44 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2016  OmpA/MotB domain protein  29.96 
 
 
305 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  27.21 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
246 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  27.65 
 
 
275 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  32.03 
 
 
219 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  32.62 
 
 
228 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0641  OmpA/MotB domain-containing protein  28.63 
 
 
243 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0148  OmpA/MotB domain protein  31.6 
 
 
258 aa  104  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  29.8 
 
 
266 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  43.48 
 
 
225 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4600  OmpA/MotB domain protein  31.22 
 
 
222 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1807  OmpA/MotB  29.02 
 
 
229 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.423379  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  29.05 
 
 
223 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  29.36 
 
 
223 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  29.06 
 
 
241 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  31.12 
 
 
264 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  29.36 
 
 
223 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1169  OmpA/MotB domain protein  29.36 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00345179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  35.92 
 
 
289 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  32.62 
 
 
228 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  40.8 
 
 
225 aa  99  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  40.8 
 
 
225 aa  99  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  40 
 
 
225 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  40 
 
 
225 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  40 
 
 
225 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  40 
 
 
225 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  40 
 
 
225 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  31.87 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  27.87 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  30.99 
 
 
277 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  37.9 
 
 
242 aa  97.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  33.12 
 
 
291 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>