More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2360 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 337 aa  654    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 337 aa  654    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  96.44 
 
 		 337 aa  594  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  75.67 
 
 		 337 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  76.56 
 
 		 337 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  74.18 
 
 		 337 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  60.53 
 
 		 343 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  61.11 
 
 		 342 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  59.94 
 
 		 342 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  58.77 
 
 		 341 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  57.65 
 
 		 340 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  58.77 
 
 		 341 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  60.23 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  57.14 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  56.85 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  56.36 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  58.02 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  59.06 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  54.81 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  56.05 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  54.97 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  55.39 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  55.1 
 
 		 343 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  55.35 
 
 		 338 aa  331  9e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  48.8 
 
 		 375 aa  328  7e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  50.15 
 
 		 314 aa  326  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  52.65 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  44.5 
 
 		 374 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  48.03 
 
 		 362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  43.3 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  43.39 
 
 		 348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  42.47 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  52.97 
 
 		 427 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  45.75 
 
 		 799 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  44.92 
 
 		 525 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  44.49 
 
 		 525 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  44.49 
 
 		 525 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  41.33 
 
 		 648 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  40.82 
 
 		 784 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  42.86 
 
 		 463 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  29.53 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  28.22 
 
 		 287 aa  95.9  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  41.88 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 		 245 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  30.74 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  29.24 
 
 		 271 aa  90.9  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  38.66 
 
 		 256 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  44.25 
 
 		 249 aa  89  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 		 246 aa  89.4  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  41.54 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  27.31 
 
 		 289 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 269 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  42.48 
 
 		 268 aa  86.3  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  38.52 
 
 		 281 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  28.81 
 
 		 256 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  40.31 
 
 		 305 aa  86.3  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  36.29 
 
 		 179 aa  85.9  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  34.32 
 
 		 244 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  41.23 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  37.07 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  37.82 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  38.52 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  38.52 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  28.29 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  28.04 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  41.23 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  36.21 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  36.21 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  40.5 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  38.14 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  39.32 
 
 		 261 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  39.32 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  40.5 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  34.72 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  28.91 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.06 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  38.02 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  38.02 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  35.53 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  37.3 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  38.94 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  29.9 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  37.82 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  34.45 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  38.6 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  35.29 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  28.78 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  28.63 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  32.77 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  39.67 
 
 		 228 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  36.13 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 259 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 253 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  33.93 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  32.77 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>