More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2160 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 337 aa  666    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  64.04 
 
 		 345 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  59.94 
 
 		 341 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  61.9 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  59.94 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  58.48 
 
 		 342 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  60.23 
 
 		 341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  58.48 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  60.42 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  57.64 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  59.65 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  55.81 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  58.91 
 
 		 337 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  57.89 
 
 		 341 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  56.27 
 
 		 343 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  55.23 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  55.23 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  55.98 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  59.17 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  54.36 
 
 		 342 aa  362  4e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  58.28 
 
 		 337 aa  361  9e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  58.28 
 
 		 337 aa  361  9e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  56.64 
 
 		 337 aa  348  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  50 
 
 		 314 aa  333  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  56.51 
 
 		 338 aa  332  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  46.9 
 
 		 375 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  49.71 
 
 		 329 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 		 374 aa  281  8.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  44.41 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  45.56 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  41.83 
 
 		 348 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 342 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  50.46 
 
 		 427 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  45.92 
 
 		 525 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  48.25 
 
 		 799 aa  199  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  45.49 
 
 		 525 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  40.52 
 
 		 463 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  42.92 
 
 		 525 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  41.22 
 
 		 648 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  42.04 
 
 		 784 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  31.88 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  38.98 
 
 		 257 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  31.95 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  39.83 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 		 245 aa  92.8  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  27.27 
 
 		 287 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  29.25 
 
 		 289 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  35.9 
 
 		 244 aa  90.5  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  35.77 
 
 		 271 aa  89.7  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  41.53 
 
 		 286 aa  89.4  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  37.82 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  40 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  38.28 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 		 269 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  40.68 
 
 		 288 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  38.94 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  36.2 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 		 268 aa  87.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  39.32 
 
 		 269 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  29.95 
 
 		 266 aa  86.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 242 aa  86.3  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  36.97 
 
 		 285 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  36.2 
 
 		 296 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  47.56 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  36.13 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  48.05 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  27.63 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  36.13 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  35.29 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27640  Flagellar motor protein  41.53 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  37.29 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2320  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000584823  hitchhiker  0.000182851 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  36.29 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.84 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 290 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  35.29 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  32.05 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  38.84 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  50.67 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  36.51 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  39.83 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  36.07 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  39.83 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  49.33 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  37.93 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  34.45 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  40.52 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  37.19 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  38.02 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  27.31 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  38.02 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>