More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5470 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  96.93 
 
 
228 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  83.33 
 
 
223 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  82.46 
 
 
223 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  83.33 
 
 
223 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2358  OmpA/MotB family outer membrane protein  83.91 
 
 
226 aa  344  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.995561  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  77.19 
 
 
219 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4600  OmpA/MotB domain protein  61.43 
 
 
222 aa  228  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1375  putative flagellar motor protein (MotB)  53.88 
 
 
230 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  34.92 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  35.68 
 
 
263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  34.82 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  32.41 
 
 
288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  34.98 
 
 
285 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  34.98 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  34.16 
 
 
285 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  33.05 
 
 
279 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  35.68 
 
 
288 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  32.92 
 
 
285 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  35.62 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  31.2 
 
 
254 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  31.9 
 
 
261 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  32.46 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  30.74 
 
 
273 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  33.33 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  29.87 
 
 
273 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  32.6 
 
 
257 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  29.44 
 
 
257 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  31.74 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  30.89 
 
 
271 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  32.91 
 
 
249 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  44 
 
 
225 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  31.56 
 
 
290 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  31.6 
 
 
295 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  28.98 
 
 
253 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  32.88 
 
 
244 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  40.16 
 
 
225 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  31.3 
 
 
295 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  44.08 
 
 
252 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  40.16 
 
 
225 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  34.08 
 
 
251 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0641  OmpA/MotB domain-containing protein  29.52 
 
 
243 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  40.16 
 
 
225 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  32 
 
 
225 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  40.16 
 
 
225 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  40.16 
 
 
225 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  32 
 
 
225 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  40.16 
 
 
225 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  31.12 
 
 
296 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  40.16 
 
 
225 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  30.2 
 
 
275 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  28.51 
 
 
241 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  40.94 
 
 
227 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  31.12 
 
 
296 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  32.1 
 
 
296 aa  101  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  31.82 
 
 
260 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2180  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 
235 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.736201  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  33.07 
 
 
281 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 
259 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 
280 aa  99  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  33.62 
 
 
242 aa  98.6  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  31.39 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  30.11 
 
 
286 aa  97.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  42.54 
 
 
338 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.33 
 
 
263 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27640  Flagellar motor protein  47.75 
 
 
275 aa  96.3  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  30.04 
 
 
305 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  28.07 
 
 
238 aa  95.9  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  28.69 
 
 
266 aa  95.5  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  43.1 
 
 
294 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  31.47 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  30.26 
 
 
259 aa  94  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  26.69 
 
 
271 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 
427 aa  92.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  37.12 
 
 
287 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  26.05 
 
 
265 aa  92  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  42.98 
 
 
286 aa  91.7  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2377  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 
295 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447675  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  24.57 
 
 
261 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  44.35 
 
 
323 aa  90.1  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3481  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2320  OmpA/MotB domain-containing protein  41.74 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000584823  hitchhiker  0.000182851 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  41.41 
 
 
469 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  27.9 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  39.52 
 
 
283 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  27.9 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  24.57 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  38.81 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  41.94 
 
 
305 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  39.37 
 
 
256 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  27.12 
 
 
258 aa  89.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1807  OmpA/MotB  30.4 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.423379  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  46.79 
 
 
290 aa  89  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  43.36 
 
 
453 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  28.4 
 
 
267 aa  88.6  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  28.25 
 
 
271 aa  88.2  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  47.12 
 
 
305 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  42.24 
 
 
375 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>