More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3670 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  683    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  78.13 
 
 		 343 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  79.3 
 
 		 342 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  77.84 
 
 		 343 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  71.43 
 
 		 343 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  71.14 
 
 		 343 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  71.14 
 
 		 343 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  65.31 
 
 		 314 aa  450  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  59.77 
 
 		 342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  58.6 
 
 		 341 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  58.31 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  58.55 
 
 		 343 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  57.73 
 
 		 340 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  58.31 
 
 		 342 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  58.89 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  57.43 
 
 		 341 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  58.24 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  55.33 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  57.43 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  58.33 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  55.07 
 
 		 338 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  56.76 
 
 		 337 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  54.81 
 
 		 337 aa  338  8e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  54.81 
 
 		 337 aa  338  8e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  48.13 
 
 		 375 aa  338  9e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  55.39 
 
 		 337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  48.39 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  46.87 
 
 		 342 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  44.01 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 374 aa  275  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  42.12 
 
 		 348 aa  275  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  42.77 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  49.36 
 
 		 525 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  49.36 
 
 		 525 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  47.11 
 
 		 463 aa  228  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  48.29 
 
 		 648 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  46.75 
 
 		 784 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  41.39 
 
 		 427 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  46.78 
 
 		 525 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  48.03 
 
 		 799 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  31 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  34.93 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  34.87 
 
 		 256 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  33.02 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  30.57 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  39.29 
 
 		 179 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  32.31 
 
 		 266 aa  99  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  35.15 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  41.88 
 
 		 257 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  34.71 
 
 		 245 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  40.5 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  41.23 
 
 		 249 aa  93.2  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  34.93 
 
 		 323 aa  93.6  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  42.02 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  30.4 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0819  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 		 244 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.912264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 		 272 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  40.68 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  40.65 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 		 271 aa  89  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  37.8 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 271 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 		 268 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 248 aa  87.4  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 275 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 257 aa  86.3  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  39.73 
 
 		 269 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  38.51 
 
 		 285 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  38.79 
 
 		 256 aa  85.9  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  37.29 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  35.77 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  41.32 
 
 		 251 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  34.24 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  36.67 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1013  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  37.39 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  37.84 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  35.59 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  37.2 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  39.47 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  27.76 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  37.16 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  40.87 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  30.69 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  30.74 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  34 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  43.48 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  43.48 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  42.24 
 
 		 266 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  34 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  38.33 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  24.58 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1148  hypothetical protein  36.3 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  36.42 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  34.15 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.25 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  35.25 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>