More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1661 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
342 aa  695    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  39.87 
 
 
295 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2016  OmpA/MotB domain protein  38.64 
 
 
305 aa  199  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  38.8 
 
 
295 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 
290 aa  189  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0748  OmpA/MotB domain-containing protein  35.86 
 
 
302 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0967  OmpA/MotB domain protein  39.56 
 
 
313 aa  162  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  35.42 
 
 
271 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  34.89 
 
 
268 aa  146  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
280 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  35.91 
 
 
290 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  31.5 
 
 
275 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  34.31 
 
 
288 aa  135  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  34.57 
 
 
249 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2980  OmpA/MotB domain protein  29.62 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.567172 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  30.03 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  32.14 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  30.37 
 
 
266 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  30.1 
 
 
271 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  29.33 
 
 
279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  32.72 
 
 
267 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  32.12 
 
 
254 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  29.35 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  31.14 
 
 
253 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 
257 aa  126  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  31.29 
 
 
275 aa  125  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  30.97 
 
 
261 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  31.02 
 
 
275 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  31.5 
 
 
258 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0148  OmpA/MotB domain protein  36.43 
 
 
258 aa  123  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.08 
 
 
263 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  30.25 
 
 
305 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  29.48 
 
 
257 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  28.86 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  30.07 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  30.71 
 
 
238 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  29.69 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  31.23 
 
 
261 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  29.6 
 
 
269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  29.14 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  27.31 
 
 
269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  30 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  29 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  28.24 
 
 
245 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  29 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  29.08 
 
 
305 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  28.1 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  28.46 
 
 
296 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  28.89 
 
 
285 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  31.11 
 
 
261 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  31.11 
 
 
261 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  30.32 
 
 
262 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  29.96 
 
 
262 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  29.45 
 
 
285 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  28.89 
 
 
285 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  30.32 
 
 
262 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  31.11 
 
 
251 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  28.25 
 
 
267 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  27.78 
 
 
296 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  28.89 
 
 
295 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  29.28 
 
 
259 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  28.89 
 
 
295 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  29.25 
 
 
246 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  31.11 
 
 
236 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  26.77 
 
 
251 aa  102  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  28.14 
 
 
266 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  26.95 
 
 
330 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  28.15 
 
 
263 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  27.24 
 
 
257 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  29.6 
 
 
305 aa  99.4  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  26.92 
 
 
358 aa  99.4  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  28.32 
 
 
305 aa  99  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  30.57 
 
 
264 aa  99  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  27.82 
 
 
271 aa  98.6  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1978  OmpA/MotB domain-containing protein  28.28 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0364656  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.8 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.300073  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 
323 aa  95.9  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  27.96 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  24.1 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27640  Flagellar motor protein  37.9 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1375  putative flagellar motor protein (MotB)  28.09 
 
 
230 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  23.38 
 
 
273 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  26.01 
 
 
308 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  29.89 
 
 
259 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1997  OmpA/MotB domain protein  28.35 
 
 
300 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  28.68 
 
 
241 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2221  OmpA/MotB domain protein  28.32 
 
 
274 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  29.2 
 
 
296 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  25.26 
 
 
259 aa  90.1  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.96 
 
 
259 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3226  OmpA/MotB domain protein  27.97 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0410363  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  25.09 
 
 
260 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1018  OmpA/MotB domain protein  28.52 
 
 
266 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5607  flagellar motor protein MotB  29.86 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707499  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  30.23 
 
 
280 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0641  OmpA/MotB domain-containing protein  29.84 
 
 
243 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1169  OmpA/MotB domain protein  25.35 
 
 
266 aa  87  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00345179  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5298  OmpA/MotB domain protein  28.98 
 
 
277 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>