More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5365 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
337 aa  667    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  78.04 
 
 
337 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  76.56 
 
 
337 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  76.56 
 
 
337 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  73.89 
 
 
337 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  73.29 
 
 
337 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  62.69 
 
 
342 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  62.09 
 
 
343 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  62.43 
 
 
342 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  59.4 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  59.21 
 
 
340 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  61.54 
 
 
341 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  59.39 
 
 
341 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  55.95 
 
 
343 aa  381  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  55.95 
 
 
343 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  58.04 
 
 
343 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  60 
 
 
341 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  55.65 
 
 
343 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  55.39 
 
 
343 aa  371  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  56.64 
 
 
337 aa  368  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  53.04 
 
 
345 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  56.25 
 
 
343 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  53.8 
 
 
342 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  47.34 
 
 
375 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  52.91 
 
 
338 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  48.81 
 
 
314 aa  323  4e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  53.56 
 
 
329 aa  297  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  44.17 
 
 
374 aa  295  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  46.96 
 
 
362 aa  282  6.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  45.1 
 
 
326 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  41.09 
 
 
348 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  41 
 
 
342 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  48.19 
 
 
427 aa  235  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  44.07 
 
 
525 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  44.07 
 
 
525 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  43.72 
 
 
525 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  46.49 
 
 
799 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  42.29 
 
 
648 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  39.59 
 
 
784 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  39.21 
 
 
463 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  46.9 
 
 
249 aa  93.6  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  28.64 
 
 
287 aa  93.2  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  31.45 
 
 
292 aa  92.8  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  39.5 
 
 
256 aa  89.7  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  40.17 
 
 
245 aa  89.4  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  39.06 
 
 
305 aa  89  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  37.1 
 
 
179 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  31.31 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 
275 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  39.5 
 
 
269 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  32.52 
 
 
256 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  36.59 
 
 
271 aa  87.8  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 
257 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  39.13 
 
 
273 aa  87  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  38.79 
 
 
273 aa  87  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 
290 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  30.52 
 
 
291 aa  86.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 
246 aa  86.7  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  30.05 
 
 
236 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  40.16 
 
 
267 aa  86.3  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  40.35 
 
 
338 aa  85.9  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  28.98 
 
 
289 aa  85.9  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  29.49 
 
 
266 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  38.98 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 
228 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  38.66 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  32.16 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.62 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  43.1 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  36.97 
 
 
295 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  38.79 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  39.66 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  36.13 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  38.52 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  41.23 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  38.02 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  34.45 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  37.82 
 
 
296 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  36.75 
 
 
244 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 
223 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  34.45 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3481  OmpA/MotB domain protein  36.07 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  34.45 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  36.97 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  36.13 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  34.45 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  30.58 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  30.1 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>