More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3344 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
345 aa  689    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  62.57 
 
 
337 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  59.01 
 
 
342 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  59.88 
 
 
341 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  59.01 
 
 
342 aa  396  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  58.72 
 
 
343 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  59.3 
 
 
341 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  57.1 
 
 
343 aa  391  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  55.62 
 
 
343 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  59.59 
 
 
341 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  57.35 
 
 
340 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  59.3 
 
 
341 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  55.65 
 
 
343 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  55.39 
 
 
342 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  56.52 
 
 
337 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  55.65 
 
 
343 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  55.07 
 
 
343 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  56.81 
 
 
337 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  55.36 
 
 
343 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  57.23 
 
 
337 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  57.23 
 
 
337 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  57.23 
 
 
337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  54.49 
 
 
337 aa  346  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  47.47 
 
 
375 aa  344  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  50.14 
 
 
314 aa  324  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  53.33 
 
 
338 aa  322  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 
374 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  47.53 
 
 
362 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  48.35 
 
 
329 aa  278  7e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  42 
 
 
348 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  41.91 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  41.69 
 
 
342 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  51.83 
 
 
427 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  46.55 
 
 
525 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  46.55 
 
 
525 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  48.75 
 
 
799 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  46.12 
 
 
525 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  44.08 
 
 
784 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  45.3 
 
 
648 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  41.94 
 
 
463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  34.93 
 
 
256 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  43.22 
 
 
338 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  46.02 
 
 
256 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  40.17 
 
 
245 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  30.42 
 
 
292 aa  96.3  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  41.53 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  38.98 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  28.63 
 
 
289 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  42.61 
 
 
249 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
290 aa  93.6  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  40.16 
 
 
281 aa  93.2  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  39.34 
 
 
244 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  42.37 
 
 
286 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  39.5 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  30.7 
 
 
287 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  29 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 
323 aa  89.4  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 
246 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 
266 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  34.96 
 
 
271 aa  88.2  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  29.89 
 
 
225 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  39.5 
 
 
266 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
271 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  37.12 
 
 
305 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.63 
 
 
263 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 
268 aa  86.3  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 
271 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  38.98 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  39.84 
 
 
223 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  39.84 
 
 
223 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  38.66 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 
228 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  35.5 
 
 
272 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  39.29 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  34.92 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  37.9 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  34.92 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  34.92 
 
 
225 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  34.92 
 
 
225 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  34.92 
 
 
225 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  34.92 
 
 
225 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  34.92 
 
 
225 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  38.98 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  37.4 
 
 
305 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  42.74 
 
 
269 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  35.71 
 
 
225 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  35.71 
 
 
225 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  36.13 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  37.07 
 
 
271 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  28.96 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  36.13 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  33.86 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  36.13 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  36.13 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  34.36 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>