More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2744 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  677    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  93.27 
 
 
343 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  83.92 
 
 
342 aa  587  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  83.04 
 
 
341 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  82.46 
 
 
341 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  85.67 
 
 
341 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  81.87 
 
 
341 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  62.28 
 
 
340 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  61.16 
 
 
343 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  58.89 
 
 
343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  58.89 
 
 
343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  63.28 
 
 
337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  60.35 
 
 
343 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  61.79 
 
 
337 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  58.31 
 
 
342 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  58.43 
 
 
345 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  58.31 
 
 
343 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  60.06 
 
 
343 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  57.31 
 
 
337 aa  378  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  62.69 
 
 
337 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  61.11 
 
 
337 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  61.19 
 
 
337 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  61.11 
 
 
337 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  53.06 
 
 
314 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  56.84 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  46.49 
 
 
375 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
329 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  44.11 
 
 
374 aa  289  6e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 
362 aa  288  7e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  44.97 
 
 
326 aa  279  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  41.69 
 
 
348 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  44.9 
 
 
342 aa  257  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 
427 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  45.18 
 
 
525 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  45.18 
 
 
525 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  45.18 
 
 
525 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  44.49 
 
 
799 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  45.71 
 
 
784 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  46.05 
 
 
648 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  45.09 
 
 
463 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  34.16 
 
 
256 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  33.18 
 
 
245 aa  99.4  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  39.67 
 
 
271 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  31.37 
 
 
287 aa  96.7  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  35.14 
 
 
288 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  43.97 
 
 
257 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  28.68 
 
 
289 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  40.32 
 
 
179 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  43.1 
 
 
249 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  47.47 
 
 
246 aa  89.7  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 
269 aa  89.4  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  40.17 
 
 
244 aa  89.4  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  40.35 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  40.87 
 
 
256 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  30.23 
 
 
266 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  29.17 
 
 
225 aa  87  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  39.83 
 
 
290 aa  87.4  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  30.95 
 
 
266 aa  86.7  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 
280 aa  86.7  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  38.94 
 
 
268 aa  85.9  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.09 
 
 
259 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  28.35 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  28.29 
 
 
225 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  45.22 
 
 
259 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 
275 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  28.29 
 
 
225 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
238 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  42.37 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  28.57 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  39.32 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  28.57 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  31.65 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  37.61 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  28.57 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  28.57 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  28.57 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  28.57 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  28.57 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  27.37 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  36.43 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  29.63 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  35.59 
 
 
257 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  36.69 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  34.19 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  33.85 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  40.95 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  41.51 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0148  OmpA/MotB domain protein  35.83 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.39 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  39.66 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  38.84 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  39.62 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>