More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3904 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  100 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  97.88 
 
 		 285 aa  567  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  97.88 
 
 		 285 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  94.04 
 
 		 285 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  80.43 
 
 		 295 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  78.62 
 
 		 295 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  77.54 
 
 		 296 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  68.15 
 
 		 296 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  67.7 
 
 		 296 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  67.15 
 
 		 269 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  51.55 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  44.03 
 
 		 305 aa  232  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 288 aa  224  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  43.75 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  41.54 
 
 		 338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  42.96 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  44.18 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  43.7 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  40.08 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  41.7 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  40.71 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  41.04 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1525  putative chemotaxis MotB protein  37.79 
 
 		 329 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  39.59 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  34.41 
 
 		 271 aa  168  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.13 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  39.76 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  35.34 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  34.24 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  34.39 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  33.47 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  33.61 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  35.83 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  32.44 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  32.71 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  34.15 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3422  OmpA/MotB domain-containing protein  37.66 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  38.33 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  34.27 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  34 
 
 		 238 aa  143  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 267 aa  142  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  33.62 
 
 		 244 aa  142  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  33.85 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  34.38 
 
 		 249 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  34.07 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  34.26 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  33.06 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  33.86 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  32.79 
 
 		 265 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  30.83 
 
 		 271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  33.6 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  30.58 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  32.1 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  32.1 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  33.47 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  32.51 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  32.44 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  31.27 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  34.8 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  32.1 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  32.1 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  33.6 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  28.68 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  32.08 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  34.41 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  33.88 
 
 		 219 aa  118  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  30.83 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2016  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  29.55 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  35.5 
 
 		 228 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  31.23 
 
 		 236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1375  putative flagellar motor protein (MotB)  31.6 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  29.06 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  31.62 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  43.7 
 
 		 242 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  35.06 
 
 		 228 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.33 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  31.15 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  31.15 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  32.19 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  38.03 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  44.35 
 
 		 225 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  37.32 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  27.2 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  31.01 
 
 		 259 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1169  OmpA/MotB domain protein  27.02 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00345179  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  30.04 
 
 		 223 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  32.82 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  43.86 
 
 		 179 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0641  OmpA/MotB domain-containing protein  28.81 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4600  OmpA/MotB domain protein  29.73 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0148  OmpA/MotB domain protein  31.98 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  34.59 
 
 		 291 aa  99.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  37.09 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  40.35 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  28.51 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  38.81 
 
 		 227 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  28.81 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>