More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2095 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  100 
 
 		 784 aa  1471    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  63.67 
 
 		 648 aa  314  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  61.51 
 
 		 525 aa  297  6e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  61.92 
 
 		 525 aa  296  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  62.34 
 
 		 525 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  56.11 
 
 		 463 aa  282  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  60.61 
 
 		 799 aa  281  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  46.77 
 
 		 343 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  46.56 
 
 		 343 aa  227  6e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  46.77 
 
 		 343 aa  226  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  45.04 
 
 		 343 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  46.37 
 
 		 343 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  45.56 
 
 		 342 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  45.16 
 
 		 343 aa  216  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  45.88 
 
 		 375 aa  212  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 362 aa  209  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  44.66 
 
 		 343 aa  204  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  44.58 
 
 		 345 aa  203  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  45.28 
 
 		 342 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  55.62 
 
 		 314 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  44.98 
 
 		 341 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  39.18 
 
 		 340 aa  195  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  46.59 
 
 		 341 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  43.78 
 
 		 342 aa  195  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  44.98 
 
 		 341 aa  195  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 		 374 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  40.78 
 
 		 326 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  42.4 
 
 		 342 aa  185  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  44.58 
 
 		 341 aa  185  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  42.67 
 
 		 337 aa  184  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  38.16 
 
 		 338 aa  183  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  42.21 
 
 		 337 aa  179  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  41.98 
 
 		 348 aa  175  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  41.2 
 
 		 337 aa  173  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  41.2 
 
 		 337 aa  173  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  41.2 
 
 		 337 aa  173  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  41.22 
 
 		 337 aa  173  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  42.04 
 
 		 329 aa  169  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  39.52 
 
 		 337 aa  168  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  38.06 
 
 		 427 aa  167  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 		 280 aa  111  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 256 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  46.28 
 
 		 287 aa  106  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  46.28 
 
 		 266 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  42.15 
 
 		 289 aa  99.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  32.52 
 
 		 292 aa  96.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.74 
 
 		 263 aa  97.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  39.5 
 
 		 290 aa  94.4  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  42.64 
 
 		 179 aa  94  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  39.66 
 
 		 266 aa  91.7  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  40.68 
 
 		 275 aa  90.5  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 		 257 aa  90.1  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  40.83 
 
 		 299 aa  90.5  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  39.83 
 
 		 245 aa  89.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 		 269 aa  87  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 		 268 aa  86.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  39.86 
 
 		 285 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  40.16 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  39.19 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  40 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  35.26 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  38.51 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  40.17 
 
 		 249 aa  84  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2921  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 		 277 aa  84  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751625  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 		 241 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  34.04 
 
 		 285 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  41.89 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  37.93 
 
 		 256 aa  82.4  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  38.51 
 
 		 285 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  33.11 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  33.62 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  41.54 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  31.88 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0148  OmpA/MotB domain protein  35.54 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  38.52 
 
 		 242 aa  79.7  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  37.39 
 
 		 271 aa  79  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  37.59 
 
 		 288 aa  79.3  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  36.49 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  35.81 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  37.29 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  32.32 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  34.15 
 
 		 241 aa  76.6  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  30.95 
 
 		 342 aa  77.4  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  35.66 
 
 		 175 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  30.95 
 
 		 271 aa  77.4  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 307 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  37.91 
 
 		 269 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 248 aa  76.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  31.49 
 
 		 257 aa  75.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  33.52 
 
 		 323 aa  76.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  35.15 
 
 		 296 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1285  hypothetical protein  39.85 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426387  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0310  hypothetical protein  39.85 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 258 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1115  hypothetical protein  39.85 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0267  hypothetical protein  39.85 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0116  hypothetical protein  39.85 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56852  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1148  hypothetical protein  40.6 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1788  hypothetical protein  39.85 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>