More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4541 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
337 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  91.69 
 
 
337 aa  591  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  75.37 
 
 
337 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  74.18 
 
 
337 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  74.18 
 
 
337 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  73.29 
 
 
337 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  62.39 
 
 
343 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  61.79 
 
 
342 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  62.69 
 
 
341 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  61.06 
 
 
342 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  60.06 
 
 
340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  61.19 
 
 
341 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  59.52 
 
 
343 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  61.19 
 
 
341 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  60.12 
 
 
343 aa  391  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  58.33 
 
 
343 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  62.09 
 
 
341 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  58.04 
 
 
343 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  56.52 
 
 
345 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  57.74 
 
 
343 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  58.31 
 
 
337 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  57.74 
 
 
342 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  57.74 
 
 
343 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  52.68 
 
 
314 aa  337  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  55.62 
 
 
338 aa  333  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  48 
 
 
375 aa  328  6e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  44.92 
 
 
374 aa  290  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  52.63 
 
 
329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  48.32 
 
 
362 aa  282  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  45.4 
 
 
326 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  42.4 
 
 
348 aa  258  8e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  41.64 
 
 
342 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  50.68 
 
 
427 aa  226  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  45.15 
 
 
525 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  43.88 
 
 
525 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  43.88 
 
 
525 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  48.25 
 
 
799 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  41.22 
 
 
784 aa  178  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  44.64 
 
 
463 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  41.85 
 
 
648 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  30.8 
 
 
292 aa  96.7  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  27.37 
 
 
287 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  31.5 
 
 
291 aa  93.2  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  30.29 
 
 
289 aa  92.8  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  39.32 
 
 
257 aa  90.1  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  39.5 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  37.29 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  43.1 
 
 
249 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  30.52 
 
 
266 aa  85.9  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  29.27 
 
 
271 aa  85.5  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  38.52 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.22 
 
 
263 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  29.19 
 
 
245 aa  84  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  37.6 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  36 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  37.7 
 
 
267 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  36.75 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  37.72 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  35.29 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  33.55 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  35.09 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  36.13 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  34.45 
 
 
254 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
280 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  28.16 
 
 
225 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  36.13 
 
 
267 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 
228 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  35.29 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  34.45 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  33.76 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  37.07 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  34.82 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  27.48 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0641  OmpA/MotB domain-containing protein  35.2 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  38.79 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  33.08 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  33.88 
 
 
271 aa  77  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  37.07 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 
288 aa  77  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  31.6 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  32.79 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  29.26 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  36.13 
 
 
525 aa  75.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  34.48 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  33.92 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>