More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2629 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  100 
 
 
323 aa  654    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  40.67 
 
 
280 aa  202  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  37.35 
 
 
321 aa  197  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  35.31 
 
 
314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  37.92 
 
 
285 aa  155  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  38.65 
 
 
294 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  32.69 
 
 
286 aa  146  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2377  OmpA/MotB domain protein  31.23 
 
 
295 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447675  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2921  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 
277 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751625  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3481  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 
282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1593  OmpA/MotB domain protein  31.23 
 
 
290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.907299  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  30.07 
 
 
292 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  35.43 
 
 
256 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  31.53 
 
 
287 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  37.56 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  32.26 
 
 
343 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  29.9 
 
 
289 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  28.35 
 
 
299 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11308  putative flagellar motor protein MotB  40.43 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.890951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  35.22 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  35.22 
 
 
343 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  33.82 
 
 
314 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  33.73 
 
 
307 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  28.03 
 
 
291 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  35.9 
 
 
179 aa  99.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  30 
 
 
342 aa  99.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  33.04 
 
 
343 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.37 
 
 
263 aa  95.9  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  30.58 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  34.93 
 
 
343 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  31.86 
 
 
266 aa  92.8  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  36.25 
 
 
273 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  34.97 
 
 
273 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  42.06 
 
 
366 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 
366 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  32 
 
 
269 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
236 aa  89.4  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 
305 aa  89.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  37.4 
 
 
525 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 
238 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  37.4 
 
 
525 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  34.18 
 
 
648 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  31.84 
 
 
427 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  31.82 
 
 
267 aa  86.7  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  31.78 
 
 
341 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  35.66 
 
 
251 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  33.77 
 
 
271 aa  85.9  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  34.54 
 
 
525 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  32.47 
 
 
338 aa  85.9  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  33.53 
 
 
285 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  36.76 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  36.15 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  31.06 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  29.57 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  36.92 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  32.22 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  38.93 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  33.56 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  36.44 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  34.81 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  30.88 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  36.96 
 
 
374 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  29.73 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  34.35 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0819  OmpA/MotB domain protein  35.54 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.912264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  36.22 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  31.14 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  37.01 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  35.36 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5082  hypothetical protein  37.88 
 
 
217 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.343747  normal  0.389351 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  29.27 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  35.38 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  42.24 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  31.43 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  34.15 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  29.84 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  29.3 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  37.9 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1171  MotB-like flagellar protein  34.42 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  32.89 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1395  OmpA/MotB domain-containing protein  42.52 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.616253  normal  0.476019 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  27.09 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  33.33 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  34.35 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  31.13 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  37.19 
 
 
246 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3029  hypothetical protein  37.98 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1016  OmpA/MotB  41.94 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.436254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  32.56 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  36.51 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  41.38 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  29.52 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  28.5 
 
 
275 aa  77  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>