More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2377 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2377  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 295 aa  594  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447675  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  57.24 
 
 		 294 aa  333  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  42.96 
 
 		 286 aa  241  9e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  44.52 
 
 		 285 aa  236  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1593  OmpA/MotB domain protein  41.87 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.907299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2921  OmpA/MotB domain-containing protein  38.06 
 
 		 277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751625  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3481  OmpA/MotB domain protein  42.71 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11308  putative flagellar motor protein MotB  34.38 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.890951  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  31.23 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  37.68 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  35.92 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  30.6 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  31.29 
 
 		 256 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  42.42 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  30.97 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  33.71 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  39.16 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.33 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 238 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  42.19 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  39.86 
 
 		 289 aa  96.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  34.78 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  30.94 
 
 		 287 aa  95.5  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 257 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  42.98 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  32.89 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 		 236 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  36.8 
 
 		 245 aa  93.6  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  39.17 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 		 275 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  39.67 
 
 		 267 aa  92.4  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  31.4 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  36.5 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  28.47 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  36.05 
 
 		 338 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  38.73 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  40.5 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  35.29 
 
 		 179 aa  90.5  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  43.97 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  35.61 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  33.76 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 		 228 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1395  OmpA/MotB domain-containing protein  37.58 
 
 		 367 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.616253  normal  0.476019 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  31.38 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  39.67 
 
 		 259 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  34.73 
 
 		 323 aa  87.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  40.35 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  36.76 
 
 		 251 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  32.3 
 
 		 248 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  36.96 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  37.82 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  35.17 
 
 		 285 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  34.48 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  32.46 
 
 		 330 aa  85.9  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  39.32 
 
 		 219 aa  85.9  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  37.72 
 
 		 244 aa  85.9  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  34.88 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  39.84 
 
 		 257 aa  85.5  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  38.02 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  40.16 
 
 		 233 aa  85.5  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  37.6 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  32.76 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  38.58 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  32.46 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  35.14 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  37.41 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  33.71 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  38.17 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 242 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  35.56 
 
 		 525 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  38.35 
 
 		 205 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  34.81 
 
 		 525 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  37.72 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  36.96 
 
 		 648 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1375  putative flagellar motor protein (MotB)  35.2 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  34.81 
 
 		 525 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  37.12 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  36.64 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  38.02 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  40.83 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  35.48 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4600  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  37.88 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  32.23 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  36.18 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  34.85 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  35.88 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  31.33 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>