More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1300 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  100 
 
 		 296 aa  588  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  58.36 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  45.42 
 
 		 330 aa  241  7.999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  43 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  41.2 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  43.34 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  43.34 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  43.34 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  40.92 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  43.9 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  42.32 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  40.07 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  41.81 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  41.81 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  41.81 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  41.81 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  42.37 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  40.26 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  40.55 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  40.77 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  40.2 
 
 		 305 aa  215  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  40.21 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  40 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  40 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  44.72 
 
 		 280 aa  202  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  38.76 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  38.68 
 
 		 309 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  41.84 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  36.4 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  33.84 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  31.46 
 
 		 257 aa  146  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  34.06 
 
 		 281 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  36.05 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  30.92 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  34.23 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  35.43 
 
 		 269 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  29.52 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  30.89 
 
 		 275 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  27.86 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  30.23 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  33.93 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  29.43 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  30.6 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  29.64 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  29.3 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  33.85 
 
 		 248 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  31.2 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  32.95 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  28.85 
 
 		 257 aa  122  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  26.6 
 
 		 280 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  30.68 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.2 
 
 		 263 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  34.19 
 
 		 305 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  29.96 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  28.2 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  27.56 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  28.77 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  25.47 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  30 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  31.78 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  27.62 
 
 		 305 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  30.89 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  27.34 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  27.27 
 
 		 267 aa  112  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  29.92 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  29.92 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  32.13 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  33.2 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  30.68 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  31.52 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  30.27 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  33.08 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  27.67 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  27.65 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  29.77 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  29.77 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  27.27 
 
 		 253 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  26.88 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  29.12 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  27.27 
 
 		 273 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  29.84 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  31.78 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  29.39 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  28.91 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  31.27 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  29.46 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  39.55 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  34.24 
 
 		 252 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  29.57 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  28.02 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  25.84 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  28.68 
 
 		 269 aa  99  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  29.2 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2765  flagellar motor protein MotB  28.74 
 
 		 239 aa  95.1  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  42.34 
 
 		 460 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  29.85 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  39.42 
 
 		 442 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>