More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2987 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  100 
 
 
322 aa  659    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  83.69 
 
 
325 aa  564  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  83.23 
 
 
314 aa  542  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  80.76 
 
 
310 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  80.76 
 
 
310 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  80.76 
 
 
310 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  80.76 
 
 
310 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  80.06 
 
 
308 aa  521  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  79.87 
 
 
306 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  81.62 
 
 
322 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  79.87 
 
 
306 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  79.87 
 
 
306 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  79.25 
 
 
308 aa  514  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  76.49 
 
 
308 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  75.96 
 
 
318 aa  490  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  79.81 
 
 
312 aa  487  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  66.03 
 
 
305 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  61.99 
 
 
309 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  58.95 
 
 
314 aa  391  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  59.06 
 
 
309 aa  391  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  63.09 
 
 
314 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  59.31 
 
 
315 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  56.92 
 
 
318 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  48.4 
 
 
329 aa  249  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  43.41 
 
 
330 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  41.69 
 
 
296 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  38.06 
 
 
305 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  41.64 
 
 
280 aa  202  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  30.41 
 
 
275 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  34.24 
 
 
277 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  29.73 
 
 
246 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  27.09 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  30.62 
 
 
248 aa  110  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  27.81 
 
 
281 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  26.21 
 
 
266 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  28.86 
 
 
323 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  28.33 
 
 
338 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  24.68 
 
 
266 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  24.67 
 
 
267 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  42.11 
 
 
437 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  43.44 
 
 
266 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  26.69 
 
 
271 aa  102  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  25.41 
 
 
258 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  28.77 
 
 
290 aa  102  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  41.3 
 
 
438 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  41.3 
 
 
438 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  40.58 
 
 
460 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  41.3 
 
 
438 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  41.3 
 
 
438 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  41.3 
 
 
438 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  41.3 
 
 
438 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  41.3 
 
 
438 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  33.11 
 
 
271 aa  101  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  31.36 
 
 
236 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  36.2 
 
 
275 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  28.28 
 
 
265 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  40.15 
 
 
440 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  24.4 
 
 
271 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  37.68 
 
 
430 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  38.41 
 
 
442 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  25.09 
 
 
263 aa  96.3  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  33.54 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1496  OmpA/MotB  30.1 
 
 
276 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  36.77 
 
 
268 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  26.06 
 
 
254 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  27.15 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  23.73 
 
 
267 aa  93.2  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  27.15 
 
 
290 aa  92.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  37.41 
 
 
430 aa  92.4  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  26.19 
 
 
280 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  27.12 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3511  putative chemotaxis protein MotB  29.13 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  25.41 
 
 
253 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  31.61 
 
 
443 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  30.81 
 
 
256 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  33.56 
 
 
259 aa  90.1  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  30.68 
 
 
225 aa  90.5  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  24.42 
 
 
295 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2221  OmpA/MotB domain protein  30.72 
 
 
274 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  22.79 
 
 
271 aa  89.7  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  33.77 
 
 
453 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  25.51 
 
 
262 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  25.51 
 
 
262 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  31.88 
 
 
249 aa  89  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  31.18 
 
 
261 aa  89  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  36.24 
 
 
238 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  30.43 
 
 
366 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 
366 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  30.14 
 
 
245 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  28.38 
 
 
285 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  36.96 
 
 
460 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1395  OmpA/MotB domain-containing protein  29.71 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.616253  normal  0.476019 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  32.5 
 
 
248 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 
272 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  25.26 
 
 
295 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1237  OmpA/MotB  29.77 
 
 
276 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258144  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  27.27 
 
 
285 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  34.69 
 
 
406 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  28.04 
 
 
285 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  32.89 
 
 
452 aa  87  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>