More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1205 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  99.77 
 
 
438 aa  876    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  99.77 
 
 
438 aa  876    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  99.77 
 
 
438 aa  876    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  877    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  89.4 
 
 
440 aa  742    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  99.77 
 
 
438 aa  876    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  95.66 
 
 
437 aa  789    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  99.77 
 
 
438 aa  876    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  99.77 
 
 
438 aa  876    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  64.01 
 
 
460 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  59.16 
 
 
430 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  54.65 
 
 
452 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  55.76 
 
 
443 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  55.73 
 
 
413 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  54.43 
 
 
406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  46.89 
 
 
460 aa  351  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  51.82 
 
 
453 aa  348  9e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  50 
 
 
442 aa  341  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  46.76 
 
 
449 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  48.23 
 
 
449 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  36.47 
 
 
430 aa  264  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  38.95 
 
 
431 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  36.39 
 
 
447 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  36.68 
 
 
429 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  36.26 
 
 
443 aa  249  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  40.16 
 
 
433 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  40.05 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  40.05 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  39.79 
 
 
433 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  37.37 
 
 
415 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  38.12 
 
 
429 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  38.11 
 
 
456 aa  240  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  38.37 
 
 
434 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  35.84 
 
 
434 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  37.82 
 
 
426 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  37.82 
 
 
421 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  37.82 
 
 
421 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  37.82 
 
 
421 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  39.77 
 
 
434 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  36.62 
 
 
432 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  37.56 
 
 
421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  37.56 
 
 
421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  39.48 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  37.56 
 
 
421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  39.48 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  39.48 
 
 
434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  38.56 
 
 
436 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  41.12 
 
 
438 aa  223  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  36.83 
 
 
414 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  34.32 
 
 
458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  34.32 
 
 
458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  31 
 
 
469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  33.16 
 
 
494 aa  196  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  45.74 
 
 
293 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  43.04 
 
 
289 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  43.04 
 
 
289 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  31.21 
 
 
511 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  39.85 
 
 
291 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  33.78 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  33.41 
 
 
487 aa  173  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  39.02 
 
 
291 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  34.41 
 
 
463 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.75 
 
 
404 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  41.99 
 
 
275 aa  157  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  29.85 
 
 
410 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  37.55 
 
 
261 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  40.58 
 
 
290 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  33.83 
 
 
453 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  46.58 
 
 
258 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  39.81 
 
 
258 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  38.16 
 
 
273 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  38.89 
 
 
258 aa  147  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  31.73 
 
 
404 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  30.75 
 
 
405 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  36.29 
 
 
271 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  34.1 
 
 
278 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  34.01 
 
 
453 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  43.9 
 
 
257 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  40.49 
 
 
252 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  40.49 
 
 
252 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  43.29 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  39.26 
 
 
253 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  34.48 
 
 
289 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  39.26 
 
 
253 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  39.26 
 
 
253 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  33.48 
 
 
310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  28.29 
 
 
536 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  33.99 
 
 
289 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  28.16 
 
 
536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  33.48 
 
 
255 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  33.48 
 
 
255 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  33.5 
 
 
289 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  28.16 
 
 
535 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  33.93 
 
 
257 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  32.81 
 
 
327 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  34.15 
 
 
258 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  32.3 
 
 
282 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  31.91 
 
 
282 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  27.52 
 
 
552 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  27.52 
 
 
552 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>